[发明专利]蛋白质信号转导子网的预测方法和装置

权利要求书

1.一种蛋白质信号转导子网的预测方法，其特征在于，包括：

建立步骤：建立信号转导网络，其中，一种蛋白质为所述信号转导网络的一个节点，具有通信关系的两种蛋白质之间的通道为所述信号转导网络的一条边；

第一计算步骤：计算所述信号转导网络中每个节点和每条边的分值；

第一获取步骤：获取所述信号转导网络中的目标节点及多个第一目标信号子网，其中，所述目标节点为所述信号转导网络中节点分值最高的节点，所述第一目标信号子网为所述信号转导网络中与所述目标节点连通的信号子网；

第二计算步骤：计算每个所述第一目标信号子网的子网分值和显著性概率值；

第二获取步骤：获取所述第一目标信号子网中的多个第二目标信号子网，其中，所述第二目标信号子网为所述显著性概率值小于预设值的所述第一目标信号子网；以及

确定步骤：确定多个所述第二目标信号子网中子网分值最高的所述第二目标信号子网为所述信号转导子网。

2.根据权利要求1所述的预测方法，其特征在于，采用以下方式计算每个节点的分值：

获取节点i对应的蛋白质的实际丰度比和预设丰度比，其中，所述节点i为所述信号转导网络中的任一节点；以及

根据所述节点i对应的实际丰度比和所述目标节点对应预设丰度比，计算所述节点i的分值。

3.根据权利要求2所述的预测方法，其特征在于，根据所述实际丰度比和所述预设丰度比，计算所述节点i的分值包括：

按照公式Ei=Σk=1mxikΣj=1lwijEi′=Ei-EminEmax-EminEmin=min{E1,E2,L,EN}Emax=max{E1,E2,L,EN}]]>计算所述节点i的分值，

其中，E_i′为所述节点i的分值，x_ik为所述节点i对应的蛋白质在第k个实际样本中的实际丰度比，w_ij为所述节点i对应的蛋白质在第j个对照样本中的对照丰度比，m为所述实际样本的样本数，l为所述对照样本的样本数。