[发明专利]检测刺猬紫檀的专用探针、引物、基因芯片和方法有效
申请号: | 201410103717.9 | 申请日: | 2014-03-20 |
公开(公告)号: | CN103834742A | 公开(公告)日: | 2014-06-04 |
发明(设计)人: | 李瑶;周佳海;张颖;寿勇明 | 申请(专利权)人: | 中国科学院上海有机化学研究所;上海化学工业区医疗中心 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12M1/34;C12N15/11 |
代理公司: | 上海弼兴律师事务所 31283 | 代理人: | 薛琦;沈利 |
地址: | 200032 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 刺猬 紫檀 专用 探针 引物 基因芯片 方法 | ||
1.检测刺猬紫檀(Pterocarpus erinaceus Poir.)的专用探针,其特征在于,其是核苷酸序列如序列表中SEQ ID NO.12所示的DNA片段,或者是核苷酸序列如序列表中SEQ ID NO.12所示序列的反向互补序列的DNA片段。
2.检测刺猬紫檀的基因芯片,其特征在于,其含有权利要求1所述的专用探针。
3.检测刺猬紫檀的装置,其特征在于,其包括如权利要求1所述的专用探针或者如权利要求2所述的DNA芯片。
4.如权利要求3所述的装置,其特征在于,所述的装置还包括引物对,所述的引物对中,一条引物的核苷酸序列如序列表中的SEQ ID NO.10,另一条引物的核苷酸序列如序列表中的SEQ ID NO.11所示。
5.如权利要求4所述的装置,其特征在于,所述的引物上含有荧光标记。
6.检测刺猬紫檀的引物,其特征在于,其是核苷酸序列如序列表中SEQ ID NO.10或SEQ ID NO.11所示的DNA片段。
7.如权利要求6所述的引物,其特征在于,所述的引物上含有荧光标记。
8.一种检测刺猬紫檀的方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)制备待测样本的总DNA,作为模板,用含检测标记的引物对进行PCR扩增,获得PCR产物,所述的引物对中,一条引物的核苷酸序列如序列表中的SEQ ID NO.10,另一条引物的核苷酸序列如序列表中的SEQ ID NO.11所示;
(2)将专用探针结合于基因芯片的片基上,洗去未结合的探针,获得检测刺猬紫檀的基因芯片,所述的专用探针是核苷酸序列如序列表中SEQ ID NO.12所示的DNA片段,或者是核苷酸序列如序列表中SEQ ID NO.12所示序列的反向互补序列的DNA片段;
(3)在步骤(2)所得的检测刺猬紫檀的基因芯片中加入步骤(1)所得的PCR产物,进行杂交,洗去未杂交的PCR产物;
(4)检测步骤(3)所得的杂交后的基因芯片。
9.如权利要求8所述的方法,其特征在于,步骤(2)所述的基因芯片的片基是醛基片基,所述的探针是氨基化探针。
10.如权利要求8所述的方法,其特征在于,步骤(2)所述的基因芯片的另外的加样孔中加入花梨木管家基因检测探针,所述的花梨木管家基因检测探针的序列如序列表中SEQ ID NO.16所示序列的核苷酸片段。
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