[发明专利]SLC2A9基因单核苷酸多态性的检测无效
申请号: | 201410105555.2 | 申请日: | 2014-03-20 |
公开(公告)号: | CN103937880A | 公开(公告)日: | 2014-07-23 |
发明(设计)人: | 罗蔚锋;缪江芳;李凯;刘春风 | 申请(专利权)人: | 苏州大学附属第二医院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 苏州创元专利商标事务所有限公司 32103 | 代理人: | 范晴;夏振 |
地址: | 215004 江苏*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | slc2a9 基因 核苷酸 多态性 检测 | ||
1.一种检测SLC2A9基因单核苷酸多态性位点rs1014290的试剂盒,其特征在于所述试剂盒包括用于特异性扩增SLC2A9基因单核苷酸多态性位点rs1014290的若干个特异性引物对,所述引物对含有SLC2A9基因单核苷酸多态性位点rs1014290的上游或者下游至少15个连续的核苷酸构成的连续核苷酸序列,所述SLC2A9基因单核苷酸多态性位点rs1014290具有SEQ ID No:5的连续核苷酸序列或者具有SEQ ID No:6的连续核苷酸序列。
2.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于所述引物为SEQ ID No:1~4序列之一的正向引物或反向引物。
3.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于所述试剂盒还包括与引物序列构成PCR反应体系的Pfu缓冲液、dNTPs、MgSO4、Pfu DNA聚合酶、模板DNA,所述PCR反应体系终浓度组成为:
4.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于所述试剂盒还包括与引物序列构成PCR反应体系的Pfu缓冲液、dNTPs、MgSO4、Pfu DNA聚合酶、模板DNA、荧光染料;所述PCR反应体系的终浓度组成为:
5.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于所述荧光染料可选自DNA饱和性染料包括EvaGreen染料、PLUS染料、ResoLight染料、SYTO9染料、SYBR green染料;所述dNTP混合液包括10mM dATP、10mM dCTP、10mM dTTP、10mM dGTP的混合液。
6.一种检测SLC2A9基因单核苷酸多态性位点rs1014290的方法,其特征在于所述方法包括以下步骤:
(1)设计并选取包括含有SLC2A9基因单核苷酸多态性位点rs1014290的上游或者下游至少15个连续的核苷酸构成的连续核苷酸序列构成的若干个引物对;
(2)提取模板DNA,利用步骤(1)得到的引物对对模板DNA中SLC2A9基因单核苷酸多态性位点rs1014290进行PCR扩增;
(3)对扩增后的SLC2A9基因单核苷酸多态性位点rs1014290的单核苷酸多态性进行检测。
7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于所述步骤(2)中提取模板DNA从选自外周血细胞、外周血血清或血浆、体液、腔道的脱落物、病变新鲜组织、冰冻病变切片、石蜡病变切片中提取;进行PCR反应的条件为92~97℃预变性4~15min;92~97℃变性10~30s,56~60℃退火10~30s,70~75℃延伸10~30s,30~60个循环。
8.根据权利要求6所述的方法,其特征在于所述步骤(3)中先用琼脂糖凝胶电泳分离步骤(2)的扩增产物,然后将扩增产物进行基因测序,获得扩增后的SLC2A9基因单核苷酸多态性位点rs1014290的单核苷酸多态性检测结果。
9.根据权利要求6所述的方法,其特征在于所述步骤(2)中PCR扩增是采用实时荧光PCR技术进行扩增,检测步骤(2)的扩增产物,根据荧光信号的强度判断扩增后的SLC2A9基因单核苷酸多态性位点rs1014290的单核苷酸多态性结果。
10.一种PCR反应试剂盒在SLC2A9基因单核苷酸多态性位点rs1014290的单核苷酸多态性检测方面的应用。
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