[发明专利]试剂盒及确定待测DNA样本预定SNP位点的基因型的方法在审

专利信息
申请号: 201410129862.4 申请日: 2014-04-01
公开(公告)号: CN104975070A 公开(公告)日: 2015-10-14
发明(设计)人: 徐谋胜;曹旸;袁亚燕;王珊 申请(专利权)人: 湖北维达健基因技术有限公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) 11201 代理人: 李志东
地址: 430075 湖北省武*** 国省代码: 湖北;42
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摘要:
搜索关键词: 试剂盒 确定 dna 样本 预定 snp 基因型 方法
【权利要求书】:

1.一种试剂盒,其特征在于,包括:

第一核酸分子,所述第一核酸分子具有SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列;

第二核酸分子,所述第二核酸分子具有SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列;

第一探针,所述第一探针具有SEQ ID NO:3所示的核苷酸序列;以及

第二探针,所述第二探针具有SEQ ID NO:4所示的核苷酸序列,

其中,

所述探针的5’端标记有荧光报告基团,3’端标记有荧光淬灭基团,

所述第一探针与所述第二探针的荧光报告基团不同。

2.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述荧光报告基团为FAM或VIC,所述淬灭基团为MGB。

3.一种确定待测DNA样本预定SNP位点的基因型的方法,所述预定SNP位点为VKORC1基因的rs9923231位点,其特征在于,包括:

根据Taqman探针杂交法,利用权利要求1或2所述的试剂盒,将所述待测DNA样本进行荧光定量PCR;以及

对荧光定量PCR结果进行分析,以便确定待测样本预定SNP位点的基因型。

4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,利用荧光定量PCR仪,优选ABI Stepone荧光定量PCR仪进行所述荧光定量PCR。

5.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,所述荧光定量PCR的反应体系为:

5重量份的Taqman Genotyping Master Mix;

3.5重量份的超纯水;

0.5重量份的组合物;以及

1重量份的待测DNA样本,

其中,所述组合物由所述第一核酸分子、第二核酸分子、第一探针和第二探针组成。

6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,所述待测DNA样本的浓度为20ng/μl。

7.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,所述待测DNA样本来源于人唾液或外周血。

8.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,所述组合物中每种核酸分子的浓度均为18μmol/L,每种探针的浓度均为5μmol/L。

9.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,所述荧光定量PCR的反应程序为:

第一步:60℃下保持30秒;

第二步:95℃下保持10分钟;

第三步:92℃下保持15秒;

第四步:60℃下保持90秒;

第五步:循环第三步第四步50次;以及

第六步:60℃下保持30秒。

10.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,利用Stepone software V2.1对所述荧光定量PCR结果进行分析。

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