[发明专利]试剂盒及确定待测DNA样本预定SNP位点的基因型的方法在审
申请号: | 201410129862.4 | 申请日: | 2014-04-01 |
公开(公告)号: | CN104975070A | 公开(公告)日: | 2015-10-14 |
发明(设计)人: | 徐谋胜;曹旸;袁亚燕;王珊 | 申请(专利权)人: | 湖北维达健基因技术有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) 11201 | 代理人: | 李志东 |
地址: | 430075 湖北省武*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 试剂盒 确定 dna 样本 预定 snp 基因型 方法 | ||
1.一种试剂盒,其特征在于,包括:
第一核酸分子,所述第一核酸分子具有SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列;
第二核酸分子,所述第二核酸分子具有SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列;
第一探针,所述第一探针具有SEQ ID NO:3所示的核苷酸序列;以及
第二探针,所述第二探针具有SEQ ID NO:4所示的核苷酸序列,
其中,
所述探针的5’端标记有荧光报告基团,3’端标记有荧光淬灭基团,
所述第一探针与所述第二探针的荧光报告基团不同。
2.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述荧光报告基团为FAM或VIC,所述淬灭基团为MGB。
3.一种确定待测DNA样本预定SNP位点的基因型的方法,所述预定SNP位点为VKORC1基因的rs9923231位点,其特征在于,包括:
根据Taqman探针杂交法,利用权利要求1或2所述的试剂盒,将所述待测DNA样本进行荧光定量PCR;以及
对荧光定量PCR结果进行分析,以便确定待测样本预定SNP位点的基因型。
4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,利用荧光定量PCR仪,优选ABI Stepone荧光定量PCR仪进行所述荧光定量PCR。
5.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,所述荧光定量PCR的反应体系为:
5重量份的Taqman Genotyping Master Mix;
3.5重量份的超纯水;
0.5重量份的组合物;以及
1重量份的待测DNA样本,
其中,所述组合物由所述第一核酸分子、第二核酸分子、第一探针和第二探针组成。
6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,所述待测DNA样本的浓度为20ng/μl。
7.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,所述待测DNA样本来源于人唾液或外周血。
8.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,所述组合物中每种核酸分子的浓度均为18μmol/L,每种探针的浓度均为5μmol/L。
9.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,所述荧光定量PCR的反应程序为:
第一步:60℃下保持30秒;
第二步:95℃下保持10分钟;
第三步:92℃下保持15秒;
第四步:60℃下保持90秒;
第五步:循环第三步第四步50次;以及
第六步:60℃下保持30秒。
10.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,利用Stepone software V2.1对所述荧光定量PCR结果进行分析。
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