[发明专利]一种检测低丰度分子改变的方法有效
申请号: | 201410156661.3 | 申请日: | 2014-04-18 |
公开(公告)号: | CN103898232A | 公开(公告)日: | 2014-07-02 |
发明(设计)人: | 邹鸿志;傅新晖;陈志婷;麦炽雄;黄京林 | 申请(专利权)人: | 汪建平;邹鸿志;傅新晖 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 广州粤高专利商标代理有限公司 44102 | 代理人: | 陈卫 |
地址: | 510655 广东省广州市天*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 低丰度 分子 改变 方法 | ||
1.一种使用digital HRM方法检测KRAS 基因突变的引物对KRAS-76-F/KRAS-76-R,其特征在于,所述KRAS-76-F引物序列如SEQ ID NO:1所示,KRAS-76-R引物序列如SEQ ID NO:2所示。
2.一种使用digital HRM方法检测KRAS 基因突变的方法,其特征在于,使用引物对KRAS-76-F/KRAS-76-R,通过digital HRM方法来检测待测标本的KRAS 基因突变情况;所述KRAS-76-F引物序列如SEQ ID NO:1所示,所述KRAS-76-R引物序列如SEQ ID NO:2所示;所述待测标本为所有样本,包括正常样本、质量较差样本、片段化严重样本或者陈旧样本。
3.根据权利要求2所述检测KRAS基因突变的方法,其特征在于,所述质量较差样本为样品浓度低于50ng/μl,纯度低于1.6或大于2.0的样本。
4.根据权利要求2所述检测KRAS基因突变的方法,其特征在于,所述陈旧样本为组织标本经石蜡包埋后3~8年的样本。
5.根据权利要求2至4任一项所述检测KRAS基因突变的方法,其特征在于,所述正常样本、质量较差样本、片段化严重样本或者陈旧样本为肠癌、胃癌、肺癌、食管癌、盆腔粘液腺癌、胰腺恶性内分泌肿瘤或肛管腺癌的正常样本、质量较差样本、片段化严重样本或者陈旧样本。
6.根据权利要求2所述检测KRAS基因突变的方法,其特征在于,所述检测方法亦适用于患者的粪便标本和血液标本的KRAS 基因4-14号密码子突变检测。
7.根据权利要求2所述检测KRAS基因突变的方法,其特征在于,使用digital HRM方法检测KRAS基因突变的方法具体为:在进行PCR扩增前,对样品DNA进行充分稀释,令样品DNA的浓度<50ng/μl,以稀释后的样品DNA为模板,配制2个以上的独立扩增体系,全部进行PCR扩增,扩增结束后对每个反应体系中的PCR产物逐一分析熔解曲线,只要有一个反应体系检测出突变型模板的熔解峰,则判断该样品为突变型样品。
8.一种使用digital HRM方法检测KRAS基因突变的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括权利要求1所述的引物对KRAS-76-F/KRAS-76-R。
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