[发明专利]RUNX1基因断裂及拷贝数增加检测试剂盒及其制备方法有效

专利信息
申请号: 201410166824.6 申请日: 2014-04-24
公开(公告)号: CN103952485A 公开(公告)日: 2014-07-30
发明(设计)人: 王宏伟;李莉;陈秀花;覃艳红;徐智芳;任方刚;郭海秀;齐喜玲;杨思遥 申请(专利权)人: 山西医科大学
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 太原晋科知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 14110 代理人: 王瑞玲
地址: 030001 *** 国省代码: 山西;14
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摘要:
搜索关键词: runx1 基因 断裂 拷贝 增加 检测 试剂盒 及其 制备 方法
【权利要求书】:

1.一种RUNX1基因断裂及拷贝数增加检测试剂盒,其特征在于:由下列成分组成:试剂I、纯化试剂Ⅱ、沉淀试剂Ⅲ、杂交缓冲试剂Ⅳ,试剂盒中各试剂用量见表1,所列试剂的量为10个探针用量:

表1

其中:试剂Ⅰ的组分及各成分浓度、用量见表2,

表2

试剂Ⅱ的组分及各成分浓度、用量见表3,

表3

试剂Ⅲ的组分及各成分浓度、用量见表4, 

表4

试剂Ⅳ的组分及各成分浓度、用量见表5,

表5

2.根据权利要求1所述的一种RUNX1基因断裂及拷贝数增加检测试剂盒,其特征在于:制备方法包括以下步骤:(1)从人类BAC克隆库中挑选RP11-177L11、RP11-77I17作为探针序列,RP11-177L11包括了人类RUNX1基因的5’端第一外显子及上游区序列,全长162kb;RP11-77I17包括了人类RUNX1基因的3’端第八外显子和下游的CLIC6基因序列,全长160kb;

(2)采用缺口平移法标记RP11-77I17为红色,标记RP11-177L11为绿色,标记探针所用具体组分以及各组分浓度、用量见表6;

表6

(3)用试剂Ⅱ将标记的探针序列纯化:按试剂Ⅱ的比例加入标记红色和绿色的探针序列各200μl及试剂Ⅱ的组成成分,混匀,-80℃静置1小时或-20℃静置过夜,然后4℃、12000rpm/min离心30min,弃上清;加入预冷的70%乙醇200μl,4℃,12000rpm/min离心10min,弃上清,45℃干燥,加入100μl去离子水,棕色管中保存;

(4)用试剂Ⅲ将纯化的探针序列沉淀,进一步纯化:取试剂Ⅱ纯化了的红色、绿色的探针各10μl,分别加入试剂Ⅲ中各组分的1/10,-80℃沉淀1h以上或过夜;取出沉淀的探针,4℃、12000rpm/min离心30min,弃上清,加入预冷的70%乙醇300μl,然后4℃、12000rpm/min离心15min,弃上清,45℃干燥5min,沉淀为半透明即可;

(5)使用前用试剂Ⅳ溶解探针:FISH操作前,将干燥的沉淀探针按照试剂Ⅳ的比例加入杂交缓冲液,一个探针用1/10的试剂Ⅳ溶解,振荡溶解,离心数秒混匀,沉淀完全溶解后备用。

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