[发明专利]三氮烯连接单元的合成及其在DNA测序中的用途有效
申请号: | 201410203327.9 | 申请日: | 2014-05-14 |
公开(公告)号: | CN104003902A | 公开(公告)日: | 2014-08-27 |
发明(设计)人: | 沈玉梅;龚兵;魏晓飞;伍新燕;邵志峰;李小卫;赵小东 | 申请(专利权)人: | 上海交通大学 |
主分类号: | C07C247/10 | 分类号: | C07C247/10;C07H19/10;C07H1/00;C09K11/06;C12Q1/68 |
代理公司: | 上海汉声知识产权代理有限公司 31236 | 代理人: | 牛山;陈少凌 |
地址: | 200240 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 三氮烯 连接 单元 合成 及其 dna 中的 用途 | ||
1.一种三氮烯连接单元,其结构式如式(I)所示:
2.根据权利要求1所述的三氮烯链接单元,其特征在于,-CH2OH连接于三氮烯结构的邻位、对位或间位;-CH2N3连接于三氮烯结构的邻位、对位或间位。
3.一种根据权利要求1所述的三氮烯连接单元的合成方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤:
A、在酸性条件下,于亚硝酸钠水溶液中,冰浴下发生重氮化反应5min~2h后,缓慢加入得化合物A
B、在三乙胺存在的条件下,化合物TsCl和化合物A发生酯化反应,得到化合物B
C、在70~90℃下,NaN3和化合物B发生取代反应,即得所述三氮烯连接单元
4.根据权利要求3所述的合成方法,其特征在于,步骤B中,所述TsCl和化合物A的摩尔比为1∶(2.0~4.0)。
5.根据权利要求3所述的合成方法,其特征在于,步骤C中,所述NaN3和化合物B的摩尔比为(1.5~3.5)∶1。
6.一种根据权利要求1所述的三氮烯连接单元在DNA测序中的用途,其特征在于,所述三氮烯连接单元与核苷酸及荧光素连接得到用于DNA合成测序的可逆终端。
7.一种用于DNA合成测序的可逆终端,其特征在于,所述可逆终端由根据权利要求1所述的三氮烯连接单元与核苷酸及荧光素连接而得;所述可逆终端的结构式如下式所示:
8.一种根据权利要求7所述的用于DNA合成测序的可逆终端的制备方法,其特征在于,所述方法包含以下步骤:
A、以无水DMF为溶剂,在TEA存在的条件下,所述三氮烯连接单元与炔基化的TAMRA(5/6)发生点击反应,得化合物C
B、在DMAP、DIPEA存在的条件下,化合物C和DSC发生酯化反应,得到中间体所述中间体与dUTP(AP3)反应,即得所述可逆终端。
9.根据权利要求8所述的制备方法,其特征在于,步骤A中,所述TAMRA(5/6)、三氮烯连接单元和TEA的摩尔比为1∶(1~3)∶(3~10)。
10.根据权利要求8所述的制备方法,其特征在于,步骤B中,所述化合物C、DSC、DMAP、DIPEA和dUTP(AP3)的摩尔比为1∶(5~12)∶(2~3)∶(2~4)∶(2~8)。
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