[发明专利]小麦背景中长穗偃麦草染色体特异标记及其应用无效
申请号: | 201410226850.3 | 申请日: | 2014-05-26 |
公开(公告)号: | CN104109666A | 公开(公告)日: | 2014-10-22 |
发明(设计)人: | 陈建民;秦树文;高勇;陈士强;张璐璐;刘广晓 | 申请(专利权)人: | 扬州大学 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/68 |
代理公司: | 南京中新达专利代理有限公司 32226 | 代理人: | 孙鸥;朱杰 |
地址: | 225009 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 小麦 背景 中长 麦草 染色体 特异 标记 及其 应用 | ||
1.小麦背景中长穗偃麦草染色体特异标记,其特征在于步骤:
(1)利用SDS酚-氯仿法微量提取基因组DNA;
(2)长穗偃麦草特异片段的PCR扩增;
(3)长穗偃麦草特异扩增片段的回收;
(4)氯化钙法制备感受态细胞;
(5)菌落PCR;
(6)长穗偃麦草染色体特异SCAR标记的建立;
所述引物根据长穗偃麦草的EST序列设计固定引物,根据SRAP引物设计随机引物,由固定引物和随机引物随机组合共56对引物,利用18条基础引物组合了56个引物组合后进行PCR扩增,选择出21个具有长穗偃麦草特异扩增的引物组合。
2.根据权利要求1所述的小麦背景中长穗偃麦草染色体特异标记,其特征在于步骤(1)利用SDS酚-氯仿法微量提取基因组DNA中,其步骤如下:
(1-1)取幼嫩叶片(约0.1g),剪碎装入2ml的离心管中,置于液氮中冷却,用研磨棒碾碎至粉末状;
(1-2)离心管放置于室温稍冷却,加入700μl的缓冲液A,轻轻混匀,然后65℃水浴20min,期间每隔5min上下颠倒混匀一次;
(1-3)取出稍冷却至室温,加入苯酚和氯仿各350μl,上下颠倒,充分混匀,抽提5min;
(1-4)12000rpm,离心10min,将上清液吸取到一个新的离心管中;
(1-5)加入约750μl氯仿,上下颠倒,充分混匀,抽提5min;
(1-6)12000rpm,离心10min,将上清液吸取到一个新的离心管中;
(1-7)加入约560μl异丙醇,轻慢混匀,室温放置10min,可见絮状沉淀;
(1-8)12000rpm,离心10min,弃去上清液;
(1-9)加500μl70%的乙醇溶液洗涤两次,每次2-3min.室温晾干;
(1-10)晾干的DNA溶解于20μlTER中,37℃温浴45min.-20℃保存备用。
3.根据权利要求1所述的小麦背景中长穗偃麦草染色体特异标记,其特征在于步骤(2)长穗偃麦草特异片段的PCR扩增中,其步骤如下:
(2-1)依据引物组合进行PCR扩增;
(2-2)PCR反应结束后以6%聚丙烯酰胺凝胶电泳检测PCR产物。
4.根据权利要求1所述的小麦背景中长穗偃麦草染色体特异标记,其特征在于步骤(3)长穗偃麦草特异扩增片段的回收中,步骤如下:
(3-1)用刀片将含有特异扩增片段的聚丙烯酰胺凝胶胶条从胶板上割下,放入1.5ml离心管中,加入TEO.1200μl,浸泡30min,用移液枪去除液体,重复2次:
(3-2)加入200μlddH20,浸泡30min,用移液枪去除液体;
(3-3)加入30μlddH20,100℃水浴10min;
(3-4)将胶块捣碎,100℃水浴10min;
(3-5)3700rpm,离心15min,20μl的PCR反应体系中加入3μl上清液作为模板,采用相应引物相同PCR程序对其进行扩增;
(3-6)以割胶回收的条带为模板PCR扩增产物与首次PCR扩增得到的对应产物,同时进行1%琼脂糖凝胶检测,若两者的电泳迁移率相同,则割胶回收的条带为目的产物;
(3-7)将1%琼脂糖凝胶上证明正确的目的产物与pMD18/19-T载体连接,具体步骤如下:在微量离心管中加入1μl的pMD18/19-T载体,加入0.1pmol至0.3pmol样品DNA,用ddH20定容至5μl,再加入5μl等量的Solutionl。16℃反应30min,并且4℃过夜。
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