[发明专利]一种蛋白质芯片样点质控及示踪方法无效
申请号: | 201410234522.8 | 申请日: | 2014-05-29 |
公开(公告)号: | CN103983640A | 公开(公告)日: | 2014-08-13 |
发明(设计)人: | 邱实;刘箐 | 申请(专利权)人: | 上海理工大学 |
主分类号: | G01N21/78 | 分类号: | G01N21/78;G01N21/88 |
代理公司: | 上海精晟知识产权代理有限公司 31253 | 代理人: | 冯子玲 |
地址: | 200093 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 蛋白质 芯片 样点质控 方法 | ||
技术领域:
本发明属于生物技术领域,尤其涉及一种蛋白质芯片,具体来说是一种蛋白质芯片样点质控及示踪方法。
背景技术:
生物芯片技术是上世纪90年代初发展起来的一种高通量、大规模并行分析检测技术,曾被Science杂志两度评为年度十大科技突破之一,它是利用分子间特异相互作用的原理,将多种技术(如生物化学、微加工、微电子、计算机等)融为一体的一项分析检测技术。与传统分析检测方法所不同的是,它形成的微阵列使生化分析反应过程高度集成于某一载体之上,高通量地分析检测成百上千种DNA、RNA、多肽、蛋白质等分子。目前常见的生物芯片有:基因芯片、蛋白质芯片、糖芯片以及其他小分子生物芯片。
在基因组学的研究背景下,为了满足人类对数以万计基因功能的大规模研究,基因芯片应运而生。基因芯片是依据碱基互补配对原则,将大量已知序列的核酸探针高密度有序固定于某一载体表面,从而对待检样品中大量核酸成分进行分析检测的技术,其高通量、快速、简便等优点满足了人们对基因的大规模分析检测的需求。目前,基因芯片主要应用于基因表达检测、杂交测序、疾病预测和诊断等领域。但是,基因水平上的研究只能初步了解基因表达产物的变化,而作为直接影响生命活动变化的蛋白质则需要经过转录、翻译、加工等多个调控步骤才能形成,所以对其功能和结构的研究将具有重大的科学意义。随着蛋白组学研究的兴起,如同起初对基因组学的研究一样,在利用传统方法对蛋白质组功能进行分析研究时,同样遇到了现有技术耗时、繁琐、通量低等一系列问题。在弥补这些研究方法缺陷时,人们自然而然地模仿了基因芯片的原理,从而研制出了蛋白质芯片。
蛋白质芯片是将各种蛋白质(如抗原、抗体)、多肽以及受体、配体等有序固定于某一载体(如滤膜、凝胶、玻片、纳米微珠和微孔板)之上,以分析检测样品中能与之特异相互作用的成分。虽然蛋白质芯片是在蛋白质组学的研究背景下产生的,但其应用不仅仅只局限于蛋白质组学。凡是有关抗体—抗原、蛋白质—蛋白质、蛋白质—核酸、蛋白质—脂类、蛋白质—小分子以及酶与底物相互作用的研究中,蛋白质芯片技术均有其独特的用途。目前主要应用于蛋白质组学、食品检验、疾病诊断、药物筛选、农林畜牧业、司法鉴定等领域。
虽然,蛋白质芯片经过20多年的发展,但目前所遇到的问题及技术难点仍较多,其中一难点即是,固相蛋白质芯片上样点的质量控制问题。因当前在蛋白质芯片的实际应用中,所使用的点样缓冲液多为无色的碳酸盐或磷酸盐缓冲液,使得芯片在点样后样点仍成无色状态,导致芯片在使用前无法对其样点的形态进行预判,样点是否呈现圆润的状态,是否会在检测显色后呈现“咖啡环”现象,从而严重影响定量检测信号值的读取,甚至点样物质是否已经点在基片上,这些都无从知晓,而现今并没有一种方法可以解决上述蛋白质芯片质量控制的问题。
丽春红(Ponceau S),是煤焦油提炼出来的原料合成的偶氮染料,作为一种生物染色剂使用,可用于硝酸纤维素膜、PVDF膜和醋酸纤维素膜上蛋白质的检测。丽春红带负电荷,可以与带正电荷的氨基酸残基结合,同时丽春红也可以与蛋白质的非极性区域相结合,从而在膜上形成红色的斑点或条带。丽春红对蛋白质的染色是可逆的,染色后可以用PBST,蒸馏水或其它适当溶液洗去。
发明内容:
针对上述现有蛋白质芯片制备技术中存在的缺陷,本发明所要解决的技术问题是提供一种蛋白质芯片样点质控及示踪方法,所述的这种蛋白质芯片样点质控及示踪方法要解决现有技术中的蛋白质芯片的质量不能有效控制的技术问题。
本发明提供了一种蛋白质芯片样点质控及示踪方法,包括一个配置点样缓冲液的步骤,所述的点样缓冲液由丽春红、Na2CO3、NaHCO3、甘油和去离子水组成,所述的甘油和去离子水的体积比为3:1~1:20,在所述的点样缓冲液中,所述的Na2CO3的质量百分比浓度为0.05%~1%,所述的NaHCO3的质量百分比浓度为0.05%~2%,所述的丽春红的质量百分比浓度为0.01%~50%;还包括一个制造芯片的步骤,采用上述的点样缓冲液稀释待点样物质至工作浓度后在固相基片上进行点样,制得蛋白质芯片;还包括一个图像分析的步骤,在所述的图像分析的步骤中,采用图像软件分析蛋白质芯片点样后使用前样点的变异系数或者肉眼观察分析样点的圆润及均匀程度。
进一步的,在点样的过程中,在55%的相对湿度下进行点样。
进一步的,在点样的过程中,点样的环境温度控制在19~21℃。
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