[发明专利]抗体工程改造方法

权利要求书

1.一种设计抗体的方法，其包括：

通过下述在亲本抗体内鉴定变异耐受位置：

(i)将其氨基酸序列与多种相关抗体的氨基酸序列进行比较，其中所述相关抗体特异性地与所述亲本抗体结合相同的抗原，并且其中所述相关抗体和所述亲本抗体获自使用所述抗原免疫的单一非人动物的细胞；和

(ii)将个体抗体之间在该位置上的氨基酸发生改变的位置鉴定为变异耐受位置；

其中所述方法还包括取代存在于所述变异耐受位置上的氨基酸以产生抗体，

其中，相关抗体组中抗体的VH区具有至少90％同一(例如，至少95％或至少98％或至少99％同一)的氨基酸序列，相关抗体组中抗体的VL区具有至少90％同一(例如，至少95％或至少98％或至少99％同一)的氨基酸序列，且任何相关的两种抗体所具有的L3CDR在长度上相同，且除了0、1或2个氨基酸改变外在序列上相同，任何相关的两种抗体所具有的H3CDR在长度上相同，且除了0、1或2个氨基酸改变外在序列上相同。

2.权利要求1的方法，其中所述方法包括：

比较所述亲本抗体的CDR的氨基酸序列与所述相关抗体的CDR；和

取代在所述CDR中的氨基酸。

3.权利要求1的方法，其中所述方法包括：

比较所述亲本抗体的构架区的氨基酸序列与所述相关抗体的相同构架区；和

取代在所述构架区中的氨基酸。

4.权利要求1的方法，其中所述单一动物是单一的兔，小鼠或鸡。

5.权利要求1-4任一项的方法，其中所述变异耐受位置的氨基酸被存在于所述相关抗体之一中的相应位置上的氨基酸取代。

6.权利要求1-4任一项的方法，其中所述变异耐受位置的氨基酸被存在于相似人类抗体中的相应位置上的氨基酸取代。

7.一种使单克隆抗体人源化的方法，包括：

通过下述鉴定单克隆抗体的变异耐受位置：

(i)将其氨基酸序列与多种相关单克隆抗体的氨基酸序列进行比较，其中所述相关单克隆抗体特异性地与所述单克隆抗体结合相同的抗原，并且其中所述相关单克隆抗体和所述单克隆抗体获自使用所述抗原免疫的单一非人动物的细胞；和

(ii)将个体抗体之间在该位置上的氨基酸发生改变的位置鉴定为变异耐受位置；

其中所述方法还包括将所述变异耐受位置上的氨基酸用存在于相似人类抗体的相应位置上的不同氨基酸取代，以产生人源化抗体,

其中，相关抗体组中抗体的VH区具有至少90％同一(例如，至少95％或至少98％或至少99％同一)的氨基酸序列，抗体的VL区具有至少90％同一(例如，至少95％或至少98％或至少99％同一)的氨基酸序列，且任何相关的两种抗体所具有的L3CDR在长度上相同，且除了0、1或2个氨基酸改变外在序列上相同，任何相关的两种抗体所具有的H3CDR在长度上相同，且除了0、1或2个氨基酸改变外在序列上相同。

8.筛选具有改善活性的单克隆抗体的方法，包括：

通过下述鉴定单克隆抗体的变异耐受位置：

(i)将其氨基酸序列和多种相关单克隆抗体的氨基酸序列进行比较，其中所述相关单克隆抗体特异性地与所述单克隆抗体结合相同的抗原，并且其中所述相关单克隆抗体和所述单克隆抗体获自使用所述抗原免疫的单一非人动物的细胞；和

(ii)将个体抗体之间在该位置上的氨基酸发生改变的位置鉴定为变异耐受位置；

其中所述方法还包括将所述的变异耐受位置上的氨基酸用不同的氨基酸来取代从而产生试验抗体；和

针对改善的活性筛选所述试验抗体,

其中，相关抗体组中抗体的VH区具有至少90％同一(例如，至少95％或至少98％或至少99％同一)的氨基酸序列，抗体的VL区具有至少90％同一(例如，至少95％或至少98％或至少99％同一)的氨基酸序列，且任何相关的两种抗体所具有的L3CDR在长度上相同，且除了0、1或2个氨基酸改变外在序列上相同，任何相关的两种抗体所具有的H3CDR在长度上相同，且除了0、1或2个氨基酸改变外在序列上相同。