[发明专利]3号染色体上与水稻干尖线虫抗性QTL连锁的SSR标记及其应用

说明书

技术领域：

本发明涉及3号染色体上一种与水稻干尖线虫抗性QTL连锁的分子标记RM5626和RM7097，可应用于分子标记辅助育种，属于水稻抗病育种和分子生物学领域。

背景技术：

水稻干尖线虫是一种水稻外寄生病原物，其典型症状是叶片尖部扭曲成干尖，该病害一旦发生会使粮食产量损失惨重(Journal ofthe faculty of Agriculture，Kyushu，University，1950，9(3)：309-333；Nematologica，1975，21(3)：351-357；Journal ofAgricultural Technology，2011，337-344)。水稻干尖线虫传统控制方法成本大，还会造成严重的环境问题(Joumal of Agricultural Science and Technology，2011，14(1)：195-203)。利用水稻品种自身抗性是控制水稻干尖线虫最经济、环保、有效的策略(Annual review ofphytopathology，2001，39(1)：285-312；Plant resistance to parasitic nematodes，2002，141-151)。

育种家曾筛选到一些水稻干尖线虫抗性品种，如cvs Arkansas Fortuna，Nira43，Asa-Hi，Binam，Domsiah等(Phytopathology，1949，39；Bulletin of the Kyushu Agricultural Experiment Station，1953，1(3)：339-349；Journal of Agricultural Science and Technology，2011，14(1)：195-203)。但有些水稻干尖线虫抗性品种要么仅在特一地区表现抗性，要么仅对水稻干尖线虫表现抗性，对其他病原物高度敏感或仅有较低的产量(Plant parasitic nematodes in subtropical and tropical agriculture，2005，87-130)。另外，水稻干尖线虫种群的遗传变异会降低抗性品种的有效抗性，甚至造成品种抗性的消失。目前，水稻品种对水稻干尖线虫抗性的遗传基础及其分子机制也不清楚。阐明水稻对干尖线虫的抗性遗传基础及其分子机制有助于更深入的了解线虫与水稻的互作机制，为线虫抗性育种奠定基础(The Plant Journal2004，38(2)：285-297)。另外，为寄主植物线虫抗性基因的鉴定和分离以及进一步在分子和生化水平上研究线虫与植物的互作机制提供了新的视野(The Plant Journal，2002，31(2)：127-136)。迄今，在甜菜、番茄、马铃薯、大豆等作物中定位到H1、GroV1、Cre、Mi3等许多线虫抗性位点(Genome，1993，36(1)：152-156；Molecular Breeding，1996，2(1)：51-60；Theoretical and Applied Genetics，1994，89(7-8)：927-930；Theoretical and Applied Genetics，1995，91(3)：457-464)。而且，已克隆到Hslpro-1、Mi-1、Hero A和Gpa2等几个线虫抗性基因并对这些抗性基因进行了遗传和功能分析(Science1997，275(5301)：832-834；Nature biotechnology，1998，16(13)：1365-1369；The Plant Journal，2002，31(2)：127-136；The Plant Journal，2000，23(5)：567-576)，这极大的增强了我们对这些寄主作物线虫抗性的分子机制的认识。然而，目前未见关于水稻品种对水稻干尖线虫抗性的数量性状位点(Quantitative Trait Locus，QTL)或基因的报道，对水稻干尖线虫的抗性研究仅在品种抗性鉴定水平上，这极大的限制了水稻干尖线虫抗性资源在抗性育种中的有效利用。

分子标记辅助育种技术有效的解决了这一问题，通过构建重要抗源的遗传连锁图谱和QTL分析，可以有效的找到与水稻干尖线虫抗性QTL连锁的分子标记，使用这些标记可以对该抗源的后代及其衍生品系在苗期进行早世代筛选，淘汰感病植株，不仅节约了成本，还提高了育种效率。

发明内容：