[发明专利]基因突变体及其应用

说明书

优先权信息

本申请请求2013年6月10日向中国国家知识产权局提交的、专利申请号为201310270648.6的专利申请的优先权和权益，并且通过参照将其全文并入此处。

技术领域

本发明涉及基因突变体及其应用。具体地，本发明涉及分离的核酸、分离的多肽、筛选易感锥杆营养不良症的生物样品的方法、筛选易感锥杆营养不良症的生物样品的系统、用于筛选易感锥杆营养不良症的生物样品的试剂盒、构建体以及重组细胞。

背景技术

锥杆营养不良(CORD)是指一系列主要是锥细胞参与的遗传性视网膜疾病。视杆细胞减少的情况可能同时发生，或后期发生。CORD患者通常会有视觉灵敏度降低，畏光，色觉异常的症状。

CORD可以以常染色体显性(adCORD)，常染色体隐性(arCORD)，或者X连锁(xlCORD)方式遗传。目前为止至少有25个基因被报道与不同遗传方式的CORD相关，涉及较多致病突变，但仍存在着相当一部分未知致病基因位点。

因而，目前对锥杆营养不良症的研究仍有待深入。

发明内容

本发明旨在至少解决现有技术中存在的技术问题之一。为此，本发明的一个目的在于提出一种能够有效筛选易感锥杆营养不良症的生物样品的方法。

本发明是基于发明人的下列工作而完成的：发明人通过高通量外显子组测序联合候选基因突变验证的方法确定了锥杆营养不良症的致病基因上的新突变。

根据本发明的第一方面，本发明提出了一种分离的核酸。根据本发明的实施例，与野生型ABCA4基因相比，所述核酸具有c.4604dup突变；或者与野生型CNGB3基因相比，所述核酸具有选自下列的至少一种突变：c.1774dup、c.129+1G>A和c.1957G>A；或者与野生型PDE6C基因相比，所述核酸具有选自下列的至少一种突变：c.1935+1del、c.2518+5G>C和c.1004+1G>A；或者与野生型RPGRIP1基因相比，所述核酸具有c.2592T>G突变；或者与野生型CACNA1F基因相比，所述核酸具有c.2542G>A突变。根据本发明的实施例，发明人确定了ABCA4、CNGB3、PDE6C、RPGRIP1和CACNA1F基因突变体，这些新突变体与锥杆营养不良症的发病密切相关，从而通过检测这些新突变体在生物样品中是否存在，可以有 效地检测生物样品是否易感锥杆营养不良症。

根据本发明的第二方面，本发明提出了一种筛选易感锥杆营养不良症的生物样品的方法。根据本发明的实施例，该方法包括以下步骤：从生物样品提取核酸样本；确定所述核酸样本的核酸序列；所述核酸样本的核酸序列或其互补序列，与野生型ABCA4基因相比具有c.4604dup突变，或者与野生型CNGB3基因相比具有选自下列的至少一种突变：c.1774dup、c.129+1G>A和c.1957G>A，或者与野生型PDE6C基因相比具有选自下列的至少一种突变：c.1935+1del、c.2518+5G>C和c.1004+1G>A，或者与野生型RPGRIP1基因相比具有c.2592T>G突变，或者与野生型CACNA1F基因相比具有c.2542G>A突变，是所述生物样品易感锥杆营养不良症的指示。通过根据本发明实施例的筛选易感锥杆营养不良症的生物样品的方法，可以有效地筛选易感锥杆营养不良症的生物样品。