[发明专利]一种水培液中微生物基因组DNA的提取方法有效
申请号: | 201410270513.4 | 申请日: | 2014-06-18 |
公开(公告)号: | CN104087573A | 公开(公告)日: | 2014-10-08 |
发明(设计)人: | 方长旬;林文雄;李程勋;李颖哲;林威鹏 | 申请(专利权)人: | 福建农林大学 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 福州元创专利商标代理有限公司 35100 | 代理人: | 蔡学俊 |
地址: | 350002 福*** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 水培 微生物 基因组 dna 提取 方法 | ||
1.一种水培液中微生物基因组DNA的提取方法,其特征在于:所述方法具体包括以下步骤:
(1)水体样品杂质的去除:取100~250ml的水培液用定性滤纸过滤3~5次,并收集滤液;进一步用孔径为0.22μm的滤膜进行超滤,通过滤膜收集水体中的菌体,剪碎滤膜并置于10ml的离心管中;
(2)水体微生物细胞裂解:往步骤(1)10ml的离心管中加入500μl无菌水,漩涡震荡,然后在液氮2~3 min和65℃水浴5min中反复冻融3~5次,冻融结束后,于4℃ 13000rpm下离心 10min,弃上清,收集沉淀,加入100μl 1×TE,重悬沉淀,加入30μl 50mg/ml的溶菌酶,37℃温浴1~3h,再加入500μl 的10% SDS,以及10ul 20mg/ml的蛋白酶K,37℃温浴1~2h;
(3)核酸游离及沉淀:步骤(2)温浴结束后加入200μl 5M的NaCl,加入100μl 65℃预热的3×CTAB/NaCl,65℃温浴1h,待冷却后,加入等体积的酚、氯仿混合液,酚、氯仿的体积比为(1:1),4℃ 11000rpm 离心10min,取上清,再加入等体积的酚、氯仿混合液,酚、氯仿的体积比为(1:1),4℃ 11000rpm 离心10min,将上清移至新管并加入等体积预冷的异丙醇,-20℃放置1h,然后4℃ 11000rpm 离心 20min,弃上清,沉淀用70%乙醇重悬并于4℃ 11000rpm 下离心 10min,弃上清,沉淀于超净工作台中吹干后溶于30~50ul的无菌水中,-80℃保存。
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