[发明专利]水稻品种9194抗黑条矮缩病位点qRBSDV9及其分子标记方法有效
申请号: | 201410291342.3 | 申请日: | 2013-03-29 |
公开(公告)号: | CN104046693A | 公开(公告)日: | 2014-09-17 |
发明(设计)人: | 万建民;刘裕强;江玲;孙志广;胡金龙;王宝祥;王琦;赵志刚;王益华;陈亮明;刘世家;刘喜;陈赛华;张文伟;田云录;王春明;徐大勇 | 申请(专利权)人: | 南京农业大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 南京天华专利代理有限责任公司 32218 | 代理人: | 傅婷婷;徐冬涛 |
地址: | 211225 江苏省南京市溧*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 水稻 品种 9194 抗黑条矮缩病位点 qrbsdv9 及其 分子 标记 方法 | ||
1.水稻品种9194抗黑条矮缩病位点qRBSDV9的分子标记方法,其特征在于:用分子标记RM3912引物:SEQ ID NO.9/SEQ ID NO.10,或者用分子标记RM257引物:SEQ ID NO.11/SEQ ID NO.12扩增水稻抗黑条矮缩病品种或育种材料DNA,如果用分子标记RM3912引物能够扩增出191bp的扩增片段,或用分子标记RM257引物能够扩增出155bp的扩增片段均标志着水稻品种抗黑条矮缩病位点qRBSDV9的存在。
2.筛选权利要求1所述的水稻品种9194抗黑条矮缩病位点的分子标记的方法,其特征在于包含如下步骤:
(1)以抗黑条矮缩病品种9194为母本,感黑条矮缩病粳稻品种苏御糯为父本,配制杂种F1,构建了包含200个单株的F2分离群体,每个F2单株通过自交获得相应的F2:3家系,进行抗黑条矮缩病鉴定;
(2)用SDS法提取亲本、F1及F2群体各株系的DNA,采用简单重复序列标记SSR对两亲本进行多态性筛选,PCR在PTC-200扩增仪上进行,扩增产物在8%聚丙烯酰胺凝胶上进行电泳分析,亲本间有多态的引物在F2群体中进行分析,获取群体基因型资料;
(3)根据连锁交换规律,利用群体基因型资料构建水稻的遗传图谱,所用软件为MAPMARKER/EXP3.0,用Kosambi函数将重组值转换为遗传距离;
(4)采用田间诱发结合室内接种鉴定进行黑条矮缩病的抗性鉴定;
(5)利用MAPMARKER/EXP3.0软件对各个分子标记的群体基因型和相应家系的黑条矮缩病抗性级别进行连锁分析,并将Kosambi函数转换为遗传距离,利用Windows QTL Cartographer V2.0软件复合区间作图法,以2cM为步长在全基因组范围内进行扫描,QTL的检测采用5%总体显著水平,相应LOD统计量的显著阈值用排列测验方法进行估计,共重复抽样1000次,同时估计了各位点的加性效应和贡献率;
(6)获得抗黑条矮缩病品种9194抗黑条矮缩病基因位点四个,分别为qRBSDV3,位于标记RM282-RM14898之间;qRBSDV6,位于标记RM20069-RM30之间;qRBSDV9,位于标记RM3912-RM257之间;qRBSDV11,位于标记RM26062-RM536之间,通过抗黑条矮缩病主基因的分子标记来检测抗性品种9194及其衍生品种(系)中是否含有该主基因位点,预测其黑条矮缩病抗性水平,大大提高抗黑条矮缩病水稻的选择效率。
3.权利要求1所述的水稻品种9194抗黑条矮缩病位点qRBSDV9的分子标记引物,其特征在于包括分子标记RM3912引物:SEQ ID NO.9/SEQ ID NO.10,或者分子标记RM257引物:SEQ ID NO.11/SEQ ID NO.12。
4.权利要求3所述的水稻品种9194抗黑条矮缩病位点qRBSDV9的分子标记引物在水稻育种中的应用。
5.根据权利要求4所述的应用,其特征在于所述的分子标记引物在快速筛选抗黑条矮缩病品种或品系中的应用。
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