[发明专利]基于质荷比误差识别能力的蛋白质二级质谱鉴定方法

权利要求书

1.一种基于质荷比误差识别能力的蛋白质二级质谱鉴定方法，其特征在于，包括如下步骤：

(1)虚拟酶解蛋白质数据库序列，并根据肽段的质量数对酶解后的肽段建立肽段数据库和肽段数据库索引；

(2)根据待分析实验图谱中母离子去电荷后的质量数在步骤(1)所述的肽段数据库中找出符合要求的候选肽段；

(3)对待分析实验图谱进行去同位素峰和选取有效峰处理；

(4)产生符合候选肽段理论图谱的实验标记图谱；

(5)统计不同离子的质量误差信息，并计算出不同离子类型在不同区间内的质荷比误差识别能力；

(6)对每个候选肽段基于质荷比误差识别能力进行打分，选择得分最高的肽段作为此实验图谱的鉴定结果，并对鉴定结果进行整体质量控制。

2.根据权利要求1所述的基于质荷比误差识别能力的蛋白质二级质谱鉴定方法，其特征在于，步骤(4)具体包括如下步骤：

1)产生候选肽段可能产生的理论碎片b、y离子；

2)若步骤1)产生b、y离子中包含S、T、E和D四种氨基酸中的一种则产生对应的丢水碎片离子b-H₂O和y-H₂O；

3)若步骤1)产生b、y离子中包含R、K、Q和N四种氨基酸中的一种则产生对应的丢氨碎片离子b-NH₃和y-NH₃；

4)若待分析二级质谱母离子价态是1价，则考虑产生一价碎片离子；

5)若待分析二级质谱母离子价态大于等于2，并且对应的碎片离子中包含R，K和H三种氨基酸其中一种时，则考虑二价碎片离子峰；

根据步骤1)～5)产生所有理论碎片离子的方法，得到候选肽段的理论图谱。

3.根据权利要求1所述的基于质荷比误差识别能力的蛋白质二级质谱鉴定方法，其特征在于，步骤(5)具体包括如下步骤：

1)统计实验峰质量误差信息以及实验峰与理论峰正确匹配与错误匹配峰数目，并将质量误差等划分为10个区间：[0,0.05],[0.05,0.1],[0.1,0.15],[0.15,0.2],[0.2,0.25],[0.25,0.3],[0.3,0.35],[0.35,0.4],[0.4,0.45],[0.45,0.5]

2)定义质荷比误差识别能力，并计算出不同离子类型在不同区间内的质荷比误差识别能力；

理论碎片离子与实验图谱质量误差识别能力的计算：

T_ij＝N(r_ij)/N(e_ij)(j＝1,2,...,10)

其中，j为第j个区间(j∈[1,10],j∈Z⁺)；i为第i种离子类型(i∈b/b-H₂O/b-NH₃/y/y-H₂O/y-NH₃)；N(r_ij)为离子类型i在区间j中正确匹配峰的数目；N(e_ij)为离子类型i在区间j中错误匹配峰的数目；T_ij为离子类型i在区间j中的质荷比误差识别能力。