[发明专利]SNP标记及其应用

说明书

本发明公开了SNP标记及其应用。其中，该组SNP标记包含：第一SNP标记，所述第一SNP标记为山羊1号染色体148054417位置的碱基T或G；第二SNP标记，所述第二SNP标记为山羊1号染色体148417531位置的碱基T或C；第三SNP标记，所述第三SNP标记为山羊1号染色体148431198位置的碱基T或C。本发明的SNP标记与山羊的角型性状紧密相关，能够有效用于山羊的分子标记辅助育种。

技术领域

本发明涉及SNP标记及其应用。具体地，本发明涉及一组山羊角型性状相关的SNP标记，用于检测前述一组SNP标记的引物对和试剂盒，前述一组SNP标记、一组引物对、试剂盒在山羊选育中的用途，以及检测山羊角型性状的方法。

背景技术

山羊是最早驯化的家畜之一，它为人类提供了丰富的畜产品。山羊能够在生态条件较差的环境中生存，在世界范围内有着广泛的分布，对世界农村和牧区的发展做出了重要贡献。在山羊养殖过程中，许多养殖者往往更偏好饲养无角羊，因为，山羊锋利的角可能会对饲养员造成伤害，并且有角山羊之间的打斗会造成畜体受伤，从而影响经济价值，同时也有一些养殖者更偏好饲养有角羊，因为羊角可以用来制作精美的工艺品，一些还具有特殊的药用价值。但角型是复杂的数量性状，涉及多个基因、位点以及位点间的相互作用，极易受到环境的影响。传统的选择手段难以取得有效进展。分子标记辅助选择，可以通过影响选择时间、选择强度以及准确性而极大地提高这类性状的选择效果。

目前应用较广泛的分子遗传标记技术有：限制性片段长度多态分析技术(Restriction Fragment Length Polymorphism，RFLP)、随机引物扩增多态性DNA技术(Random Amplified Polymorphism DNA,RAPD)、扩增片段长度多态性分析技术(AmplifiedFragment Length Polymorphism,AFLP)、单核苷酸多态性标记(single nucleotidepolymorphism,SNP)等。其中，SNP标记具有遗传稳定、突变率低、便于自动化检测等优点，因此开发与山羊角型相关的SNP遗传标记将对培育符合养殖需求的有角或无角山羊新品种(系)产生重大影响。但是，目前可用于山羊角型选择的分子标记报道的不多，因此，开发与角型相关的分子标记，对于提高山羊角型选择效率，培育所需角型山羊具有非常重要的意义。

发明内容

本发明旨在至少解决现有技术中存在的技术问题之一。为此，本发明的一个目的在于提出一组与山羊角型性状相关，能够有效用于山羊选育的SNP标记。

其中，需要说明的是，SNP(single nucleotide polymorphism,SNP，即单核苷酸多态性)是1996年由美国麻省理工学院的人类基因组研究中心学者Lander提出的一类分子遗传标记，主要是指基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。SNP表现出的多态性仅涉及到单个碱基的变异，表现是有转换、颠换、插入和缺失等。

根据本发明的一个方面，本发明提供了一组山羊角型性状相关的SNP标记。根据本发明的实施例，该组SNP标记包含：第一SNP标记，所述第一SNP标记为山羊1号染色体148054417位置的碱基T或G；第二SNP标记，所述第二SNP标记为山羊1号染色体148417531位置的碱基T或C；第三SNP标记，所述第三SNP标记为山羊1号染色体148431198位置的碱基T或C。

根据本发明的实施例，所述第一SNP标记位于SEQ ID NO：1所示核苷酸序列的方框标记处：