[发明专利]马铃薯金线虫SCAR标记和LAMP快速检测方法及应用有效
申请号: | 201410331743.7 | 申请日: | 2014-07-11 |
公开(公告)号: | CN104059909A | 公开(公告)日: | 2014-09-24 |
发明(设计)人: | 彭德良;欧师琪;彭焕 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院植物保护研究所 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/68 |
代理公司: | 北京兆君联合知识产权代理事务所(普通合伙) 11333 | 代理人: | 胡敬红 |
地址: | 100193 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 马铃薯 线虫 scar 标记 lamp 快速 检测 方法 应用 | ||
1.马铃薯金线虫特异SCAR标记的DNA片段,其核苷酸序列如SEQ ID NO1所示。
2.一种马铃薯金线虫特异性SCAR-PCR快速检测方法,其特征在于:SCAR-PCR反应体系中含有特异性引物GrF1和GrR1,其序列为:
GrFI:5’-GGACCCTGACCGAATTCTGTTCCA-3’
GrRI:5’-GGACCCTGACAACGGATGGCACGA-3’。
3.根据权利要求2所述马铃薯金线虫SCAR-PCR快速检测方法,其特征在于:SCAR-PCR反应体系中含有:2.5μl的10×PCR含Mg2+的Buffer;2μl10mM dNTP;1μl特异性引物GrF1和GrR1;1U Taq DNA聚合酶;1μl模板DNA;灭菌ddH2O补足至25μl。
4.根据权利要求3所述马铃薯金线虫SCAR-PCR快速检测方法,所述的SCAR-PCR反应条件为:94℃预变性4min,然后94℃30S,65℃60S,72℃2min循环35次,72℃延伸10min后保存在4℃条件下。
5.一种马铃薯金线虫LAMP快速检测方法,所述LAMP反应体系所使用的引物是:
①GrF3:5’-CCCTGACCGAATTCTGTT-3’,
②GrB3:5’-AAATTGTCGGACGCGAAT-3’,
③GrFIP:5’-CCGACCGATGGTTCAGAGAGCCAATATAATGTACAACAACATCTC-3’,
④GrBIP:5’-GTACACACACCGGTAGGCAAGAGAGAAATATTCTCAAATCTTGGA-3’。
6.根据权利要求5所述的检测方法,其特征在于:其中的LAMP反应体系包括:
1)引物混合液:外引物GrF3和GrB3各0.2μmol/L,内引物GrFIP和GrBIP各1.6μmol/L;
2)反应混合液:4mmol/L dNTPs,20mmol/L Tris-HCl(pH8.8),10mmol/L KCl,5.75mmol/L MgS04,10mmol/L(NH4)2S04,0.1%Triton x-100,8U Bst DNA聚合酶大片段;
3)1μL DNA模板;
加灭菌双蒸馏水补足到20μL。
7.根据权利要求6所述的检测方法,其中LAMP反应条件如下:将引物混合液和反应混合液混合均匀后加入1μLDNA模板后,61~65℃温育60~90min,82℃保温10min。
8.权利要求2-7任一所述检测方法在马铃薯金线虫早期诊断或鉴别中的应用。
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