[发明专利]一种与大豆百粒重遗传特征相关的标记位点Satt557及其应用

说明书

技术领域

本发明涉及一种与大豆百粒重遗传特征相关的标记位点Satt557及其应用，属于大豆遗传技术领域。

背景技术

我国主要粮食作物中，只有大豆的单产低于世界平均水平，约为世界大豆平均单产的80％左右。我国大豆的单产每亩115kg左右，美国、巴西单产可达180kg。对于大豆产量的品种培育主要依靠育种者的专业经验，后期筛选工作周期长。尤其对大豆百粒重的分子标记研究还停留在比较初级的水平，不能应用于育种实践。所以提高大豆的单产对我国大豆生产具有重要意义。

控制大豆合适的百粒重是实现大豆高产的有效办法。但是，目前对可以用于大豆育种过程中父母本筛选的标记位点的报道较少，对于实现在育种前期对亲本或者杂交后代的百粒重遗传背景进行选择的手段和方法还比较有限。

发明内容

为解决上述问题，本发明提供了一对辅助鉴定大豆百粒重遗传特征的专用引物，所采取的的技术方案如下：

本发明的一个目的在于提供一种与大豆百粒重遗传特征相关的标记位点，所述标记位点位于大豆C2连锁群上，紧密连锁标记为SSR引物Satt557。

所述标记位点，对应专用引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示。

所述标记位点应用于大豆的遗传育种，具体用于辅助鉴定和筛选大豆的百粒重遗传特征。

本发明的另一个目的在于提供一种利用所述标记位点鉴定大豆百粒重遗传特征的方法，该方法的步骤如下：

1)提取新鲜待测大豆样品中的基因组DNA；

2)以步骤1)所得的待测大豆样品基因组DNA为模板，利用Satt775专用引物进行PCR扩增，所述引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示；

3)通过SSR电泳检测步骤2)所获得的扩增产物，银染显影后扩增产物中含有520bp DNA片段的待测大豆为候选具有减小百粒重遗传性状的大豆。

所述方法用于鉴定大豆的百粒重遗传特征。

本发明的另一个目的在于提供一种利用所述标记位点筛选大豆百粒重遗传特征的方法，该方法的步骤如下：

1)提取新鲜待测大豆样品中的基因组DNA；

2)以步骤1)所得的待测大豆样品基因组DNA为模板，利用Satt775专用引物进行PCR扩增，所述引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示；

3)通过SSR电泳检测步骤2)所获得的扩增产物，银染显影后扩增产物中含有520bp DNA片段的待测大豆为候选具有减小百粒重遗传性状的大豆。

所述方法用于筛选大豆的百粒重遗传特征。

所述PCR扩增，共35个循环，循环开始前先于95℃下处理5min，然后进入循环，所述循环的温度和延伸时间程序是：先94℃30s，然后60℃30s，最后72℃1min，循环结束后再于72℃下处理10min。

具体而言，本发明提供的SSR标记在鉴定大豆百粒重方面的应用，是根据大豆SSR位点设计的引物，利用引物的产物带型特征对大豆品种进行分子鉴定。

本发明所述大豆百粒重遗传特征是在251份大豆种质资源和以北豆5号为母本(父本包括多马卡·托利萨、坡黄、Harosoy、绿75、中特1号、NOVA、Century、烟黄3号、东农163、杜纳吉卡、Amsoy、中豆27、95-5383、艾卡166、大明白豆子、瑞丰2号、Biogedulote、中黄4号、天鹅蛋ZDD02114和东山69)的遗传群体中，均得到了证实。

本发明有益效果如下：

由于在大豆中与百粒重相关的基因还没克隆出来，利用标记位点对大豆育种进行分子辅助选择是一个比较经济的方法，尤其是对百粒重进行直接选择。本发明的方法克服了常规育种中因表型选择易受环境因素干扰而导致育种效率低等问题，可以利用Satt557标记的专用引物对大豆百粒重遗传特性进行早期世代选择而缩短育种周期，从而较快的筛选出籽粒合适的大豆材料。本发明可用于大豆的育种，以提高育种的效率和大豆的产量和质量。

附图说明

图1为大豆百粒重QTL一致性图谱。

图2为Satt557在C2连锁群上的位置。

图3为卡方分析与T-测验的资源等位基因的分层分析。

图4为等位基因的在资源中效应分析。

图5为关键等位基因资源和群体中的变化率；