[发明专利]基于模糊测度的基因重要度追踪方法在审
申请号: | 201410361374.6 | 申请日: | 2014-07-25 |
公开(公告)号: | CN104091096A | 公开(公告)日: | 2014-10-08 |
发明(设计)人: | 王金凤 | 申请(专利权)人: | 华南农业大学 |
主分类号: | G06F19/10 | 分类号: | G06F19/10 |
代理公司: | 广州市华学知识产权代理有限公司 44245 | 代理人: | 黄磊 |
地址: | 510642 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 模糊 测度 基因 重要 追踪 方法 | ||
1.基于模糊测度的基因重要度追踪方法,其特征在于所述方法包括:将人体的各个基因看作预测特征,通过模糊积分的变形构造线性方程组,采用L1-norm归一化方法求解模糊测度值,获得一组带有少量非零值的解,从而追踪到与之相对应的基因或基因组合对疾病影响的重要度。
2.根据权利要求1所述的基于模糊测度的基因重要度追踪方法,其特征在于所述方法包括以下步骤:
S1、将人体的各个基因看作预测特征,而基因序列所对应的疾病分类为预测目标;
S2、通过模糊积分的变形构造线性方程组,具体如下:
S21、设一个数据集合为训练集,含有l个例子,每个例子包含一个决策特征Y和n个预测特征x1,x2,...,xn;
其中,正整数l表示数据集的大小;决策特征Y指示每个例子属于哪一类;预测特征是数字类型的,它们的值由一个n维向量f(x1),f(x2),...,f(xn)所表示;
S22、通过模糊积分的计算来完成基于模糊测度的目标值,如下式:
其中,
对于j=1,2,…,2n-1都会有空集为0的惯例;其中,表示的小数部分;上述公式中,如果将j以二进制的形式jnjn-1…j1表示,则有和
S23、根据已知的疾病DNA数据库,建立一组以模糊测度μ为未知变量的线性方程;
S3、采用L1-norm归一化方法,使得的值最小,从而会得到一组带有少量非零值的解,通过调节其中的参数λ来控制非零值的个数;
S4、根据步骤S3得到的非零值的解,追踪到与之相对应的基因及基因组合对疾病影响的重要度。
3.根据权利要求1或2所述的基于模糊测度的基因重要度追踪方法,其特征在于:所述采用L1-norm归一化方法求解模糊测度值直接调用LASSO函数包来完成。
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