[发明专利]基于模糊测度的基因重要度追踪方法在审

专利信息
申请号: 201410361374.6 申请日: 2014-07-25
公开(公告)号: CN104091096A 公开(公告)日: 2014-10-08
发明(设计)人: 王金凤 申请(专利权)人: 华南农业大学
主分类号: G06F19/10 分类号: G06F19/10
代理公司: 广州市华学知识产权代理有限公司 44245 代理人: 黄磊
地址: 510642 广*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 基于 模糊 测度 基因 重要 追踪 方法
【权利要求书】:

1.基于模糊测度的基因重要度追踪方法,其特征在于所述方法包括:将人体的各个基因看作预测特征,通过模糊积分的变形构造线性方程组,采用L1-norm归一化方法求解模糊测度值,获得一组带有少量非零值的解,从而追踪到与之相对应的基因或基因组合对疾病影响的重要度。

2.根据权利要求1所述的基于模糊测度的基因重要度追踪方法,其特征在于所述方法包括以下步骤:

S1、将人体的各个基因看作预测特征,而基因序列所对应的疾病分类为预测目标;

S2、通过模糊积分的变形构造线性方程组,具体如下:

S21、设一个数据集合为训练集,含有l个例子,每个例子包含一个决策特征Y和n个预测特征x1,x2,...,xn

其中,正整数l表示数据集的大小;决策特征Y指示每个例子属于哪一类;预测特征是数字类型的,它们的值由一个n维向量f(x1),f(x2),...,f(xn)所表示;

S22、通过模糊积分的计算来完成基于模糊测度的目标值,如下式:

fdμ=Σj=12n-1zjμj]]>

其中,

对于j=1,2,…,2n-1都会有空集为0的惯例;其中,表示的小数部分;上述公式中,如果将j以二进制的形式jnjn-1…j1表示,则有和{i|frc(j2i)[0,12)}={i|ji=0};]]>

S23、根据已知的疾病DNA数据库,建立一组以模糊测度μ为未知变量的线性方程;

S3、采用L1-norm归一化方法,使得的值最小,从而会得到一组带有少量非零值的解,通过调节其中的参数λ来控制非零值的个数;

S4、根据步骤S3得到的非零值的解,追踪到与之相对应的基因及基因组合对疾病影响的重要度。

3.根据权利要求1或2所述的基于模糊测度的基因重要度追踪方法,其特征在于:所述采用L1-norm归一化方法求解模糊测度值直接调用LASSO函数包来完成。

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