[发明专利]利用基因芯片检测黄芪甲苷诱导RMMVECs基因表达谱的方法有效
申请号: | 201410369458.4 | 申请日: | 2014-07-30 |
公开(公告)号: | CN104087682A | 公开(公告)日: | 2014-10-08 |
发明(设计)人: | 董虹;胡格;张涛;段慧琴;姜代勋;穆祥;陈武 | 申请(专利权)人: | 北京农学院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 北京和信华成知识产权代理事务所(普通合伙) 11390 | 代理人: | 胡剑辉 |
地址: | 102200 北*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 利用 基因芯片 检测 黄芪 诱导 rmmvecs 基因 表达 方法 | ||
1.利用基因芯片检测黄芪甲苷诱导RMMVECs基因表达谱的方法,其特征在于:包括以下步骤:
(1)制备并纯化大鼠心肌膜微血管内皮细胞RMMVECs;
(2)培养二代RMMVECs,将黄芪甲苷溶解于维持培养基中,浓度为10μg/ml,在37℃、5%CO2的条件下,将RMMVECs继续培养9h;
(3)将RMMVECs充分裂解,提取总RNA;
(4)纯化、定量总RNA;
(5)反转录合成First-strand cDNA;
(6)合成Second-strand cDNA;
(7)体外转录合成cRNA;
(8)cRNA反转录;
(9)荧光标记后进行基因芯片杂交,最后进行数据分析。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:所述步骤(1)中采用差速贴壁法对所制备的RMMVECs进行纯化。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:所述步骤(3)中充分裂解的方法为:将RMMVECs用37℃预热的PBS清洗3遍,加入2ml Trizol溶液,静置5min,用移液枪吹打,使RMMVECs充分裂解,转入离心管,于-80℃冰箱保存待用;
提取总RNA的方法为:将于-80℃冰箱保存的溶于Trizol液中的细胞样品解冻,12000rpm,4℃离心5min,弃沉淀,将上清转入一新的离心管内;按Trizol:氯仿为5:1的体积量加入氯仿,剧烈振荡混匀至粉牛奶状,室温静置3min,12000rpm,4℃离心15min,取上清至一新离心管,加入等体积异丙醇,混匀,室温静置5min,12000rpm,4℃离心15min,可见白色RNA沉淀;弃去上清,缓慢地沿管壁加入75%乙醇1ml,使沉淀悬浮于乙醇中,7500rpm,4℃离心15min;弃去上清,再加入75%乙醇1ml,重复上步;而后吸去所有上清,待残余乙醇挥发尽后加入50μl DEPC水溶解RNA 沉淀,-20℃冷冻保存。
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:所述步骤(5)中反转录合成First-strand cDNA的方法步骤为:
A.取总RNA500ng,调整体积到4μL;
B.加入基因表达谱外参1μl;
C.配制反转录Master Mix,其中First Strand Bμffer Mix4μL,First Strand Enzyme Mix1μL,轻轻混匀,短暂离心置于冰上;取配好的5μL Master Mix分别转移至含有总RNA样品的0.2mL离心管中;
D.轻轻混匀溶液,瞬时离心后42℃反应2小时;将PCR仪的热盖温度也设置成42℃,避免溶液蒸到管壁上;反应完后冰浴5分钟。
5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:所述步骤(6)中合成Second-strand cDNA的方法步骤为:
A.配制Second-strand Master Mix,其中Nμclease-free Water13μL,Second-strand Bμffer Mix5μL,Second-strand Enzyme Mix2μL,轻轻混匀,短暂离心后冰浴;取上步反应完毕的样品管中加入配好的20μL Second Strand Master Mix;
B.轻轻混匀,16℃反应1小时,65℃ 10min;
C.反应结束后将反应物置于冰上继续合成反应,或者迅速冻存于-20℃。
6.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:所述步骤(7)中体外转录合成cRNA的方法步骤为:
A.cRNA合成:配制体外转录Master Mix,其中Nμclease-free Water4μL,T7Bμffer Mix20μL,T7Enzyme Mix6L,轻轻混匀,短暂离心,往上一反应中准备好的样品管中加入30μL Master Mix;
B.轻柔混匀,40℃反应16.5小时;
C.反应完成后,准备纯化cRNA;
D.纯化、定量cRNA。
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