[发明专利]利用基因芯片检测黄芪甲苷诱导RMMVECs基因表达谱的方法有效

专利信息
申请号: 201410369458.4 申请日: 2014-07-30
公开(公告)号: CN104087682A 公开(公告)日: 2014-10-08
发明(设计)人: 董虹;胡格;张涛;段慧琴;姜代勋;穆祥;陈武 申请(专利权)人: 北京农学院
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 北京和信华成知识产权代理事务所(普通合伙) 11390 代理人: 胡剑辉
地址: 102200 北*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 利用 基因芯片 检测 黄芪 诱导 rmmvecs 基因 表达 方法
【权利要求书】:

1.利用基因芯片检测黄芪甲苷诱导RMMVECs基因表达谱的方法,其特征在于:包括以下步骤: 

(1)制备并纯化大鼠心肌膜微血管内皮细胞RMMVECs; 

(2)培养二代RMMVECs,将黄芪甲苷溶解于维持培养基中,浓度为10μg/ml,在37℃、5%CO2的条件下,将RMMVECs继续培养9h; 

(3)将RMMVECs充分裂解,提取总RNA; 

(4)纯化、定量总RNA; 

(5)反转录合成First-strand cDNA; 

(6)合成Second-strand cDNA; 

(7)体外转录合成cRNA; 

(8)cRNA反转录; 

(9)荧光标记后进行基因芯片杂交,最后进行数据分析。 

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:所述步骤(1)中采用差速贴壁法对所制备的RMMVECs进行纯化。 

3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:所述步骤(3)中充分裂解的方法为:将RMMVECs用37℃预热的PBS清洗3遍,加入2ml Trizol溶液,静置5min,用移液枪吹打,使RMMVECs充分裂解,转入离心管,于-80℃冰箱保存待用; 

提取总RNA的方法为:将于-80℃冰箱保存的溶于Trizol液中的细胞样品解冻,12000rpm,4℃离心5min,弃沉淀,将上清转入一新的离心管内;按Trizol:氯仿为5:1的体积量加入氯仿,剧烈振荡混匀至粉牛奶状,室温静置3min,12000rpm,4℃离心15min,取上清至一新离心管,加入等体积异丙醇,混匀,室温静置5min,12000rpm,4℃离心15min,可见白色RNA沉淀;弃去上清,缓慢地沿管壁加入75%乙醇1ml,使沉淀悬浮于乙醇中,7500rpm,4℃离心15min;弃去上清,再加入75%乙醇1ml,重复上步;而后吸去所有上清,待残余乙醇挥发尽后加入50μl DEPC水溶解RNA 沉淀,-20℃冷冻保存。 

4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:所述步骤(5)中反转录合成First-strand cDNA的方法步骤为: 

A.取总RNA500ng,调整体积到4μL; 

B.加入基因表达谱外参1μl; 

C.配制反转录Master Mix,其中First Strand Bμffer Mix4μL,First Strand Enzyme Mix1μL,轻轻混匀,短暂离心置于冰上;取配好的5μL Master Mix分别转移至含有总RNA样品的0.2mL离心管中; 

D.轻轻混匀溶液,瞬时离心后42℃反应2小时;将PCR仪的热盖温度也设置成42℃,避免溶液蒸到管壁上;反应完后冰浴5分钟。 

5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:所述步骤(6)中合成Second-strand cDNA的方法步骤为: 

A.配制Second-strand Master Mix,其中Nμclease-free Water13μL,Second-strand Bμffer Mix5μL,Second-strand Enzyme Mix2μL,轻轻混匀,短暂离心后冰浴;取上步反应完毕的样品管中加入配好的20μL Second Strand Master Mix; 

B.轻轻混匀,16℃反应1小时,65℃ 10min; 

C.反应结束后将反应物置于冰上继续合成反应,或者迅速冻存于-20℃。 

6.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:所述步骤(7)中体外转录合成cRNA的方法步骤为: 

A.cRNA合成:配制体外转录Master Mix,其中Nμclease-free Water4μL,T7Bμffer Mix20μL,T7Enzyme Mix6L,轻轻混匀,短暂离心,往上一反应中准备好的样品管中加入30μL Master Mix; 

B.轻柔混匀,40℃反应16.5小时; 

C.反应完成后,准备纯化cRNA; 

D.纯化、定量cRNA。 

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