[发明专利]一种冰草着丝粒特异的Gypsy逆转座子序列及其应用

说明书

技术领域

本发明属于生物技术领域，具体涉及一种冰草着丝粒特异的Gypsy逆转座子序列及其应用。

背景技术

逆转座子可以分为长末端逆转座子和非长末端逆转座子，它在谷类作物中是常见的。在植物着丝粒中，逆转座子和微卫星DNA是最丰富的DNA元件，并且和着丝粒特异组蛋白CENH3相关联。小麦中由于缺少微卫星重复使得着丝粒逆转座子占主导地位。长末端逆转座子有Ty1-copia和Ty3-gypsy两个大群组成。CCS1和pSau3A9是Ty3-gypsy类逆转座子的一部分，在谷类作物的着丝粒处是非常保守的。除了小麦族特异的着丝粒逆转座子外，一些物种特异的着丝粒逆转座子也分离获得，而冰草属中还未见这方面的研究。所以，获得一个冰草特异的着丝粒逆转座子对于研究冰草着丝粒的结构、功能以及演化过程具有重要意义。

作为小麦改良重要的遗传资源，冰草属含有许多高产特性，如分蘖能力强、多花多小穗等，同时对旱、寒等非生物胁迫及白粉病、锈病等生物胁迫具有抗性。李立会等利用采自中国新疆的冰草(A.cristatum)Z559与普通小麦(Triticum aestivum L.)Fukuho杂交，通过进一步回交和自交获得了多个小麦-冰草异源二体附加系。小麦-冰草远缘杂交的成功及异源附加系的建立为将冰草P基因组的优异基因转移到小麦提供了前提。大量易位系的获得为冰草优异基因的有效利用提供了可能，而冰草染色质的追踪和鉴定就需要一个简单有效的手段。P基因组特异的着丝粒逆转座子序列的获得和基于此开发的PCR分子标记可以作为基因组特异的分子标签来对导入小麦的外源染色质进行追踪检测。

综上所述，由于着丝粒逆转座子在植物演化中的意义，以及冰草在小麦改良中的重要作用，急需在冰草属中开发P基因组特异的着丝粒逆转座子序列。

发明内容

本发明的目的是提供一种冰草着丝粒特异的Gypsy逆转座子序列及其应用。

本发明提供的冰草着丝粒特异的Gypsy逆转座子(分子标记，命名为特异DNA分子)，为如下(a)或(b)：(a)序列表的序列1自5’末端第37-803位核苷酸所示的DNA分子；(b)序列表的序列1所示的DNA分子。

本发明还保护一种特异引物对，由序列表的序列2所示的单链DNA分子和序列表的序列3所示的单链DNA分子组成。

本发明还保护所述特异引物对在鉴定待测植物材料是否含有来源于冰草染色体着丝粒区的遗传物质中的应用。

本发明还保护一种检测待测植物材料是否含有来源于冰草染色体着丝粒区的遗传物质的方法，包括如下步骤：以待测植物材料的基因组DNA为模板，采用所述特异引物对进行PCR扩增，如果得到PCR扩增产物、待测植物材料含有来源于冰草染色体着丝粒区的遗传物质，如果没有得到PCR扩增产物、待测植物材料可能不含有来源于冰草染色体着丝粒区的遗传物质。

所述PCR扩增产物的大小具体可为767bp±5bp。

本发明还保护所述特异DNA分子在鉴定待测植物材料是否含有来源于冰草染色体着丝粒区的遗传物质中的应用。

本发明还保护一种检测待测植物材料是否含有来源于冰草染色体着丝粒区的遗传物质的方法，包括如下步骤：采用所述特异DNA分子作为探针，对待测植物染色体进行荧光原位杂交，如果具有荧光信号、待测植物材料含有来源于冰草染色体着丝粒区的遗传物质，如果不具有荧光信号、待测植物材料可能不含有来源于冰草染色体着丝粒区的遗传物质。