[发明专利]磁珠法提取细菌基因组DNA的试剂盒及其提取方法有效
申请号: | 201410388366.0 | 申请日: | 2014-08-08 |
公开(公告)号: | CN104212793B | 公开(公告)日: | 2017-04-19 |
发明(设计)人: | 郝荣章;宋宏彬;李杨;赵荣涛;许金坤;卢晓;董世彪;邱少富;王勇;贾雷立;李鹏;谢靖;王立贵;吴志豪 | 申请(专利权)人: | 中国人民解放军疾病预防控制所 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 杭州求是专利事务所有限公司33200 | 代理人: | 邱启旺 |
地址: | 100071*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 磁珠法 提取 细菌 基因组 dna 试剂盒 及其 方法 | ||
1.一种磁珠法提取细菌基因组DNA的试剂盒,其特征在于:其包括缓冲液A、缓冲液B、缓冲液C、磁珠悬浮液D、缓冲液E、缓冲液F、缓冲液G七种组分;
所述缓冲液A终浓度组成为:20-50mmol/L葡萄糖、10-30mmol/L三羟甲基氨基甲烷盐酸盐、5-20mmol/L乙二胺四乙酸,溶剂为高压灭菌水,缓冲液A终PH=8.0-8.5;
所述缓冲液B终浓度组成为:15-25mg/ml蛋白酶K、1-5mol/L盐酸胍、5-25mmol/L柠檬酸钠、1-2%曲拉通、0.5-5mmol/L EDTA,溶剂为高压灭菌水,缓冲液B终PH=4.0-5.5;
所述缓冲液C成分组成为:无水乙醇溶液;
所述缓冲液E终浓度组成为:1-5mol/L醋酸钠,体积分数为20-40%无水乙醇,溶剂为高压灭菌水,缓冲液E终PH=4.0-5.5;
所述缓冲液F终浓度组成为:10-30mmol/L Tris-HCl、0.5-5mmol/L EDTA、5-25mmol/L柠檬酸钠和0.3-0.7 L/L的无水乙醇,溶剂为高压灭菌水 ,缓冲液F终PH=8.0-8.5;
所述缓冲液G终浓度组成为:10-30mmol/L Tris-HCl、0.5-5mmol/L EDTA,溶剂为高压灭菌水,缓冲液G终PH=8.0-8.5;
所述磁珠悬浮液D成分组成为:每200mmol/L氯化钠水溶液中含有50mg单分散Fe3O4@SiO2-AEAPS纳米磁珠;
所述单分散Fe3O4@SiO2-AEAPS纳米磁珠通过以下步骤制备得到:
(1)溶剂热法制备单分散的四氧化三铁纳米球;
(2)采用改进的Stöber法,在四氧化三铁纳米球外包覆二氧化硅,得到单分散的Fe3O4@SiO2纳米球,具体为:称取0.1g步骤(1)制备得到的四氧化三铁纳米球,向其中依次加入20ml去离子水、80ml无水乙醇和1ml质量分数为28%的氨水,超声混合均匀后向混合液中加入1ml正硅酸乙酯, 20°C下机械搅拌6小时;反应完毕后,将所得溶液离心,并依次用去离子水和乙醇清洗3次,制得单分散的二氧化硅包覆四氧化三铁纳米球,将所得产物在60°C烘箱中干燥待用;
(3)使用硅烷偶联剂氨乙基氨丙基聚二甲基硅氧烷对步骤(2)获得的Fe3O4@SiO2进行硅烷化处理,得到Fe3O4@SiO2-AEAPS;具体为:称取0.1g步骤(2)得到的Fe3O4@SiO2纳米球,加入到20ml二甲基甲酰胺中,超声分散后得到溶液A;将10ml的氨乙基氨丙基聚二甲基硅氧烷和20ml的二甲基甲酰胺混合均匀后,加入一定量的丁二酸酐使得混合溶液pH值维持在3.9~4.1,60°C下机械搅拌3小时,得到溶液B;将溶液A、B混合后加入20ml去离子水,在60°C下继续机械搅拌5小时后,将所得溶液离心,并依次用去离子水和乙醇清洗3次,制得单分散的硅烷化的二氧化硅包覆四氧化三铁纳米球Fe3O4@SiO2-AEAPS。
2.一种权利要求1所述的试剂盒提取细菌基因组DNA的方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)取待测细菌培养液1-1.5ml置于2.0ml EP管中,12000 rpm离心1-3min,收集菌体,加入150-300μl 缓冲液A;
(2)向步骤(1)EP管中加入150-300μl缓冲液B,45-65°C水浴孵育5-10min;
(3)向步骤(2)孵育后的EP管中加入150-300μl缓冲液C,混匀后静置5-10min;
(4)向步骤(3)静置后的EP管中加入10-50μl磁珠悬浮液D,将EP管置于磁力架上,静置10-60s后去除液体;
(5)将步骤(4)EP管从磁力架上取下,加入200-600μl缓冲液E,混匀混匀后将EP管置于磁力架上,静置10-60s后去除液体,再将EP管从磁力架上取下,加入200-1000μl缓冲液F,抽打混匀或振荡混匀后将EP管置于磁力架上,静置10-60s后去除液体,室温静置5-10min;
(6)将步骤(5)EP管从磁力架上取下,加入50-100μl缓冲液G,混匀后将EP管置于45-65°C水浴孵育5-10min,取出后将EP管置于磁力架上静置10-60s后将上清液转移至收集管中,完成细菌DNA的提取。
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