[发明专利]一种可视化鉴定美洲大蠊的方法及试剂盒在审
申请号: | 201410396082.6 | 申请日: | 2014-08-12 |
公开(公告)号: | CN104651486A | 公开(公告)日: | 2015-05-27 |
发明(设计)人: | 胡佳;岳巧云;邱德义;陈健;吴可量;刘德星;魏晓雅 | 申请(专利权)人: | 岳巧云 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 无 | 代理人: | 无 |
地址: | 528403 广东省中山市东区*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 可视化 鉴定 美洲 方法 试剂盒 | ||
1.一种可视化鉴定美洲大蠊的方法,其特征在于包括如下步骤:
(1)设计美洲大蠊的可视化探针序列,如下:
探针I,方向为5’-3’:
AACTTTATTACTAGCTAGTAGTATAGTAGAAAGAGGTGCCGGA
其中,方框框住部分为前缀序列;与划横线部分序列反向互补,起到沉默空白的作用;粗体字部分为G-四联结构;
(2)模板DNA的提取:提取待检标本的基因组DNA;
(3)COI序列的制备:以步骤(2)得到的基因组DNA为模板,以LCO1490和HCO2198为引物对进行PCR反应,再将PCR产物纯化,得到COI序列;
LCO1490:5’-GGTCAACAAATCATAAAGATATTGG-3’;
HCO2198:5’-TAAACTTCAGGGTGACCAAAAAATCA-3’;
(4)可视化扩增:以步骤(3)得到的COI序列为模板,以LCO1490和探针I为引物对进行PCR反应;
(5)显色和结果判断:向步骤(4)得到的可视化扩增产物中加入NaCl溶液,变性和复性;接着加入氯铁血红素反应,再加入H2O2和ABTS2-,观察颜色变化;颜色变为绿色,表示待检样品为美洲大蠊;颜色没有发生变化,表示待检样品非美洲大蠊。
2.根据权利要求1所述的可视化鉴定美洲大蠊的方法,其特征在于:步骤(3)中所述PCR反应的体系为:10×PCR buffer5μl,每种脱氧核苷酸浓度为2.5mM的dNTP2μl,浓度为5U/μl的EX Taq酶0.5μl,20μM的LCO14901μl、20μM的HCO21981μl,基因组DNA3μl,ddH2O补足至50μl;
步骤(3)中所述的PCR反应的条件为:94℃3min;94℃30s、50℃30s、72℃30s,20个循环;72℃10min。
3.根据权利要求1所述的可视化鉴定美洲大蠊的方法,其特征在于:步骤(3)中所述的将PCR产物纯化通过如下步骤实现:将PCR产物进行凝胶电泳,切下含目的基因条带的凝胶,提取目的基因。
4.根据权利要求1所述的可视化鉴定美洲大蠊的方法,其特征在于:步骤(4)中所述可视化扩增的体系为10×PCR buffer5μl,每种脱氧核苷酸浓度为2.5mM的dNTP2μl,浓度为5U/μl的DNA Polymerase I酶0.5μl,20μM的LCO14901μl,20μM的探针I4μl,COI序列1μl,ddH2O补足至50μl;
步骤(4)中所述可视化扩增的条件为94℃3min;94℃30s、50℃30s、72℃45s,30个循环。
5.根据权利要求1所述的可视化鉴定美洲大蠊的方法,其特征在于:步骤(5)中所述的空白沉默液为浓度为1.714M的NaCl溶液。
6.根据权利要求1所述的可视化鉴定美洲大蠊的方法,其特征在于:步骤(5)中所述的变性的条件为:95℃保温5min;
步骤(5)中所述的复性的条件为:变性后以1℃/min的速度降温至25℃保温30min;
步骤(5)中所述的反应的条件为25℃保温60min;
步骤(5)中所述的观察颜色变化的观察时间为2min。
7.根据权利要求1所述的可视化鉴定美洲大蠊的方法,其特征在于:步骤(5)中各成分的用量如下:每50μl可视化扩增产物加入0.012mol NaCl、0.108μmol hemin、0.126mmol H2O2和0.126mmol ABTS2-。
8.一种实现上述可视化鉴定美洲大蠊的方法的试剂盒,其特征在于:包含探针I;探针I的序列如下:
5’-AACTTTATTACTAGCTAGTAGTATAGTAGAAAGAGGTGCCGGA-3’;
其中,方框框住部分为前缀序列;与划横线部分序列反向互补,起到沉默空白的作用;粗体字部分为G-四联结构。
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