[发明专利]一组人肺腺癌和人结直肠癌诊断用LncRNA生物标志物有效

专利信息
申请号: 201410397937.7 申请日: 2014-08-13
公开(公告)号: CN104131108A 公开(公告)日: 2014-11-05
发明(设计)人: 毛红菊;王萍;卢韶华;白亚楠;张宏莲;金庆辉;赵建龙 申请(专利权)人: 中国科学院上海微系统与信息技术研究所
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12N15/11
代理公司: 上海光华专利事务所 31219 代理人: 张艳;李慧
地址: 200050 *** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 一组 腺癌 直肠癌 诊断 lncrna 生物 标志
【说明书】:

技术领域

发明涉及生物技术领域,特别是涉及一组人肺腺癌和人结直肠癌诊断用LncRNA生物标志物、相关试剂盒以及他们的用途。

背景技术

非小细胞肺癌是造成全世界癌症相关死亡的首要原因。它主要包括四种组织学亚型:腺癌、鳞状细胞癌、大细胞癌和其他(神经内分泌癌,良性肿瘤等)。非小细胞肺癌的五年生存率低于15%,早期诊断能有效的降低其死亡率。早期检测肺腺癌尤其重要,因为它是最常见的非小细胞肺癌类型。了解肺腺癌的遗传和分子失调机理是用于肺腺癌早期诊断的关键。

结直肠癌是常见的消化道恶性肿瘤之一,为西方经济发达国家第2位高发性恶性肿瘤,在中国,结直肠癌占消化道癌的第2位。大部分结直肠癌患者早期没有症状,超过75%的患者确诊时已属于晚期。发掘结直肠癌相关的新型生物标志物有助于进一步阐明其发病机制,同时也能为结直肠的诊治提供新靶点。

最近的研究表明90%的基因组转录成非编码RNA。非编码RNA最初被认为是“转录噪声”。然而,越来越多的证据表明这些非编码RNA在许多生理学过程中都有重要的生物学作用。非编码RNA可以分为短链非编码RNA(小于200bp)和长链非编码RNA(长于200bp)。长链非编码RNA(LncRNA)可以分为反义长非编码RNA,内含子非编码RNA(LincRNA),启动子相关LncRNA和非翻译区LncRNA。先前的研究结果表明,LncRNA在多种细胞和生物学过程中都有重要作用,例如增殖、细胞周期、染色体重塑和组蛋白修饰。另外,它们的异常表达与多种肿瘤相关,包括乳腺癌,胃癌,肝细胞性肝癌和前列腺癌。然而,LncRNA在肺腺癌和结直肠癌中的生物学功能以及LncRNA的表达与肺腺癌及结直肠癌之间的关系还处于未知阶段。

发明内容

鉴于以上所述现有技术的缺点,本发明的目的在于提供一组人肺腺癌和/或人结直肠癌诊断用LncRNA生物标志物,用于解决现有技术中的问题。本发明所提供的LncRNA生物标志物对于人肺腺癌和人结直肠癌具有很高的灵敏度和特异性,尤其对人早期肺腺癌和/或人结直肠癌具有很好的检测效果,可以作为新型的生物标志物用于肺腺癌和/或结直肠癌的检测。

为实现上述目的及其他相关目的,本发明第一方面提供一组人肺腺癌和/或人结直肠癌诊断用LncRNA生物标志物,所述LncRNA生物标志物包括:uc001gzl.3、ENST00000434223、uc004bbl.1、ENST00000540136和NR_034174。

优选的,所述人肺腺癌为人早期肺腺癌,所述人结直肠癌为人早期结直肠癌。

所述uc001gzl.3的序列如Seq ID No:1所示;

所述ENST00000434223的序列如Seq ID No:2所示;

所述uc004bbl.1的序列如Seq ID No:3所示;

所述ENST00000540136的序列如Seq ID No:4所示;

所述NR_034174的序列如Seq ID No:5所示。

优选的,所述LncRNA生物标志物还包括:ENST00000568243、uc001gch.1、NR_047562、ENST00000442037和NR_038125。

所述ENST00000568243的序列如Seq ID No:6所示;

所述uc001gch.1的序列如Seq ID No:7所示;

所述NR_047562的序列如Seq ID No:8所示;

所述ENST00000442037的序列如Seq ID No:9所示;

所述NR_038125的序列如Seq ID No:10所示。

本发明第二方面提供所述LncRNA生物标志物在制备或筛选人肺腺癌和/或人结直肠癌的肿瘤诊断药物中的用途。

本发明第三方面提供一组人肺腺癌和/或人结直肠癌诊断用LncRNA引物、标记物的组合,所述LncRNA引物包括:LncRNA的反转录引物、uc001gzl.3引物、ENST00000434223引物、uc004bbl.1引物、ENST00000540136引物、NR_034174引物。

优选的,所述LncRNA的反转录引物为随机引物。

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