[发明专利]马铃薯病毒检测引物及方法无效
申请号: | 201410400016.1 | 申请日: | 2014-08-14 |
公开(公告)号: | CN104178585A | 公开(公告)日: | 2014-12-03 |
发明(设计)人: | 李华伟;汤浩;罗文彬;纪荣昌;许泳清;邱思鑫;刘中华;邱永祥 | 申请(专利权)人: | 福建省农业科学院作物研究所 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11;C12R1/94 |
代理公司: | 福州市鼓楼区京华专利事务所(普通合伙) 35212 | 代理人: | 王美花 |
地址: | 350000*** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 马铃薯 病毒 检测 引物 方法 | ||
1.一种马铃薯病毒检测引物,其特征在于:具体包括如下五个引物对:
马铃薯X病毒引物对:上游引物5'-CTGGCAAGCACAAGGTTT-3',下游引物5'-TGGGCAGCATTCATTTCA-3';
马铃薯M病毒引物对:上游引物
5'-GCCGACTGAGCACGTGCAGCAGGT-3',下游引物5'-
GTCAGCATATGATTCCATGTCACCGG-3';
马铃薯Y病毒引物对:上游引物5'-AGAGCAAGGCAGCATCCAGT-3',下游引物5'-TGTTCATCCCCATCCATCAT-3';
马铃薯A病毒引物对:上游引物5'-ATTTAGGTACTGCTGGGACT-3',下游引物5'-TCAGGTTGCGTTGAAGAC-3';
马铃薯S病毒引物对:上游引物5'-TGTAGAGGAGCATAGAGTTGG-3',下游引物5'-CTTGTGGGCATTGTGAGC-3'。
2.根据权利要求1所述的马铃薯病毒检测引物,其特征在于:所述马铃薯X病毒引物对对马铃薯X病毒PCR扩增出138bp的产物;所述马铃薯M病毒引物对对马铃薯M病毒PCR扩增出213bp的产物;所述马铃薯Y病毒引物对对马铃薯Y病毒PCR扩增出369bp的产物;所述马铃薯A病毒引物对对马铃薯A病毒PCR扩增出468bp的产物;所述马铃薯S病毒引物对对马铃薯S病毒PCR扩增出657bp的产物。
3.一种马铃薯病毒检测方法,其特征在于:根据马铃薯X病毒、马铃薯M病毒、马铃薯Y病毒、马铃薯A病毒及马铃薯S病毒五种病毒的外壳蛋白序列保守区域分别设计合成出如权利要求1中所述马铃薯X病毒引物对、马铃薯M病毒引物对、马铃薯Y病毒引物对、马铃薯A病毒引物对及马铃薯S病毒引物对;然后建立RT-PCR检测体系,并利用所述马铃薯X病毒引物对对马铃薯叶片中的马铃薯X病毒、马铃薯M病毒引物对对马铃薯叶片中的马铃薯M病毒、马铃薯Y病毒引物对对马铃薯叶片中的马铃薯Y病毒、马铃薯A病毒引物对对马铃薯叶片中的马铃薯A病毒、马铃薯S病毒引物对对马铃薯叶片中的马铃薯S病毒进行RT-PCR反应,最后将反应产物进行1%琼脂糖凝胶电泳分析和PCR产物克隆测序比对。
4.根据权利要求3所述的马铃薯病毒检测方法,其特征在于:所述RT-PCR反应的反应体系和反应程序如下:
反应体系:反应体系的总体积为25μL,含2.0μL模板、0.15μL5U·μL-1的Ex Taq酶,2.0μL2.5mmol·L-1的dNTP,2.5μL的10×PCR buffer、0.30μL10μmol·L-1的马铃薯X病毒上游引物、0.30μL10μmol·L-1的马铃薯X病毒下游引物、0.05μL10μmol·L-1的马铃薯M病毒上游引物、0.05μL10μmol·L-1的马铃薯M病毒下游引物、0.30μL10μmol·L-1的马铃薯Y病毒上游引物、0.30μL10μmol·L-1的马铃薯Y病毒下游引物、0.15μL10μmol·L-1的马铃薯A病毒上游引物、0.15μL10μmol·L-1的马铃薯A病毒下游引物、0.2μL10μmol·L-1的马铃薯S病毒上游引物、0.2μL10μmol·L-1的马铃薯S病毒下游引物、其余成分为ddH2O;
反应程序:94℃预变性5min;94℃变性30s,56℃退火30s,72℃延伸1min,循环30次;最后72℃延伸l0min,4℃保存。
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