[发明专利]一组用于激素受体阳性乳腺癌预后的基因及其应用有效
申请号: | 201410421408.6 | 申请日: | 2014-08-25 |
公开(公告)号: | CN104263815B | 公开(公告)日: | 2017-01-25 |
发明(设计)人: | 邵志敏;黄晓燕;徐晓晶;孙冰玉;赵莹 | 申请(专利权)人: | 复旦大学附属肿瘤医院;上海伯豪生物技术有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/12 |
代理公司: | 上海浦一知识产权代理有限公司31211 | 代理人: | 高月红 |
地址: | 200032 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一组 用于 激素 受体 阳性 乳腺癌 预后 基因 及其 应用 | ||
1.一种用于激素受体阳性乳腺癌预后的多重平行检测液相基因芯片,其特征在于,包括探针;
其中,所述探针包括下列三组核苷酸序列之一:
(1)SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.8所示序列;
(2)SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.8所示序列中的每条序列的互补链;
(3)与SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.8所示的序列中的每条序列有至少70%同源性的序列。
2.如权利要求1所述的芯片,其特征在于:所述芯片还包括:SEQ ID NO.9~SEQ ID NO.12所示序列的探针。
3.一种用于激素受体阳性乳腺癌预后的试剂盒,其特征在于:包括下列三组核苷酸序列之一的探针:
(1)SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.8所示序列;
(2)SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.8所示序列中的每条序列的互补链;
(3)与SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.8所示的序列中的每条序列有至少70%同源性的序列。
4.如权利要求3所述的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒还包括:SEQ ID NO.9~SEQ ID NO.12所示序列的探针。
5.一种用于激素受体阳性乳腺癌预后的基因的评价系统,其特征在于,包括:幂函数模块和线性函数模块;
其中,幂函数模块,用于将根据权利要求1所述芯片测得的样本的基因ESR1、PGR、ERBB2和MKI67的各自表达量,放入Cox回归,并通过预后情况以及每个患者从手术到出现复发转移的时间,得到每个基因表达量在幂函数中所得到的权重,将其作为底数,每个基因的表达量作为幂指数,将四个基因相加获得的分数通过受试者工作特征曲线的最佳的临界值,能将样本分为预后好和预后差两组;
线性函数模块,用于通过二分类logist回归方法,将根据权利要求1所述芯片测得的样本的基因ESR1、PGR、ERBB2和MKI67的表达量计算其分别的权重,同时将权重与基因ESR1、PGR、ERBB2和MKI67的各自表达量相乘,获得分数,通过受试者工作特征曲线的最佳的临界值,能将样本分为预后好和预后差两组。
6.如权利要求5所述的评价系统,其特征在于:所述评价系统还包括免疫组化模块,其用于将根据样本的基因ESR1、PGR、ERBB2和MKI67所表达的蛋白量作为所述幂函数模块和线性函数模块中的基因表达量,从而获得免疫组化的幂函数和线性函数,其中,对蛋白Ki67的读数取常数e为底数的对数,以用于判断预后。
7.一组用于激素受体阳性乳腺癌预后的基因,其特征在于,包括:基因ESR1、PGR、ERBB2和MKI67。
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