[发明专利]一种检测人类Y染色体微缺失的试剂盒有效
申请号: | 201410425722.1 | 申请日: | 2014-08-26 |
公开(公告)号: | CN104152573A | 公开(公告)日: | 2014-11-19 |
发明(设计)人: | 林斯里;滕乐;田洁 | 申请(专利权)人: | 亚能生物技术(深圳)有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 深圳市博锐专利事务所 44275 | 代理人: | 张明 |
地址: | 518000 广东省深圳市宝安*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 人类 染色体 缺失 试剂盒 | ||
技术领域
本发明涉及染色体缺失检测领域,具体涉及一种检测人类Y染色体微缺失的试剂盒。
背景技术
人类Y染色体长臂上存在与精子生成密切相关的无精子因子(Azoospermia factor,AZF),无精子因子发生微小的DNA片段缺失称之为Y染色体微缺失。发生Y染色体微缺失,会引起精子生成障碍,导致少、弱、畸形精子症甚至无精子症。据WHO统计,男性原发性无精子症与少精子症患者中约10%~15%存在Y染色体微缺失。在精子生成障碍引起的男性不育患者中,Y染色微缺失的发生率是居于第二位的遗传因素。
目前,AZF被划分为3个区,即AZFa、AZFb和AZFc,这些区域的任何一个或多个缺失都将导致精子发生障碍,造成少、弱、畸形精子症甚至无精子症,最终导致不育在AZF的3个区中,每个区域均有明确的序列标签位点(Sequence tagged site,STS)可供识别;每个区域的缺失机理和缺失的断裂点均已明确。由欧洲男科协会(European Academy of Andrology,EAA)和欧洲分子遗传质控网(European Molecular Genetics Quality Network,EMQN)联合发布的1999版和2004版《Y染色体微缺失分子诊断实践指南》均推荐使用多重PCR-琼脂糖凝胶检测STS的方法来检测Y染色体的微缺失。同时,指南推荐每个区域检测2个STS,分别为AZFa检测sY84和sY86,AZFb检测sY127和sY134,AZFc检测sY254和sY255,若每个区域的2个STS发生缺失时,则代表该区域发生缺失;并指出通过以上6个STS可以检测出几乎所有临床相关的微缺失或95%文献报道的AZF微缺失,足以满足常规诊断。2013年,EAA和EMQN发布新版指南,在上述指南的基础上提出Y染色体微缺失检测的流程图,并将上述的6个STS的检测定义为“基础分析”,若“基础分析”中,某个区域的2个STS发生缺失,则必须进行后续的“拓展分析”,选择该缺失区域的近端和远端断裂点上下游的STS和Y染色体远端的异染色质标签进行检测确证,判断是否该区域发生完全缺失或Y染色体异染色质化。另外,指南明确指出,不推荐检测独立的基因特异性缺失来进行Y染色体微缺失检测。
现有的产品均能检测指南推荐的6个STS,即:sY84、sY86、sY127、sY134、sY254、sY255,可以满足2013版EAA/EMQN指南“基本分析”的需求,但均不能满足2013版EAA/EMQN指南的“拓展分析”需求。有些产品(如北京阅微、Promega)还含有2013版EAA/EMQN指南不推荐检测的STS或独立的基因。因此,根据2013版EAA/EMQN指南的检测流程图,这些产品的检测结果是不足以出具报告指导临床或进行遗传咨询的。
另外,现有产品采用的技术平台也具有局限性。
1)多重PCR-琼脂糖凝胶电泳。首先,琼脂糖凝胶电泳的检测方法,检测灵敏度低,产物量(上样量)较少时条带不易判别,难以区分弱阳性与阴性,容易造成假阳性或假阴性;其次,该方法的分辨率低,扩增片段之间必须达到30bp以上,才能较好区分。再者,琼脂糖凝胶电泳从制胶、上样到信号读取,均需人工操作,工作量大。
2)多重实时荧光PCR。该方法虽然具有简便、快速的优势,但需要设计特异性的检测探针并进行报告基团的修饰,难度较大且价格昂贵。
3)其他平台,如北京阅微(CN 102912028A)采用测序仪进行检测,北京海斯特(CN 103571957A)采用DHPLC进行检测。测序仪和HPLC价格昂贵,仪器操作和结果判读专业性要求高,不利于推广。
发明内容
本发明所要解决的技术问题是:提供一种检测人类Y染色体微缺失的试剂盒,在一次试验中同时满足“基本分析”和“拓展分析”的要求,且方便、快速、结果可靠,有效地减少操作人员的工作量,降低检测成本。
为了解决上述技术问题,本发明采用的技术方案为:提供一种检测人类Y染色体微缺失的试剂盒,包括PCR反应液Ⅰ、PCR反应液Ⅱ、PCR反应液Ⅲ和PCR反应液Ⅳ;
所述PCR反应液Ⅰ包括:特异性扩增ZFX/Y位点的引物,特异性扩增Y染色体sY254位点、sY105位点、sY1192位点、sY88位点的引物;
所述ZFX/Y位点的序列如:SEQ ID NO:1;
所述sY254位点的序列如:SEQ ID NO:2;
所述sY105位点的序列如:SEQ ID NO:3;
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