[发明专利]基于高通量测序技术的全血免疫组库探测方法有效
申请号: | 201410442470.3 | 申请日: | 2014-09-02 |
公开(公告)号: | CN104263818A | 公开(公告)日: | 2015-01-07 |
发明(设计)人: | 王凯;高帆 | 申请(专利权)人: | 武汉凯吉盈科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 武汉河山金堂专利事务所 42212 | 代理人: | 胡清堂 |
地址: | 430000 湖北省武汉市高*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 通量 技术 免疫 探测 方法 | ||
1.基于高通量测序技术的全血免疫组库探测方法,该方法包括以下步骤:
(1)全血样本中直接提取RNA;
(2)从RNA逆转录产生单链cDNA,将寡核苷酸接头序列连接到单链cDNA的3'末端,采用通用引物和序列为GAC CTC GGG TGG GAA CAC的特殊靶向引物P-VDJ为PCR反应的特殊引物对、连接寡核苷酸接头序列后的单链cDNA为PCR模板进行PCR反应,对免疫受体基因组进行扩增;
(3)高通量测序。
2.根据权利要求1所述的基于高通量测序技术的全血免疫组库探测方法,其特征在于:步骤(1)所述全血样本为新鲜血液样本或冰冻的全血样本。
3.根据权利要求1所述的基于高通量测序技术的全血免疫组库探测方法,其特征在于:步骤(2)所述逆转录方法为:采用M-MuLV逆转录酶试剂盒对RNA进行逆转录,去除反转录引入的引物,消化RNA模板得单链cDNA。
4.根据权利要求3所述的逆转录方法,其特征在于:所述去除反转录引入的引物的方法为加入AMPure XP磁珠,以80%乙醇洗涤。
5.根据权利要求3所述的逆转录方法,其特征在于:所述消化RNA模板采用RNA酶H和RNA酶A在37℃下消化RNA模板1小时。
6.根据权利要求1所述的基于高通量测序技术的全血免疫组库探测方法,其特征在于:步骤(2)所述寡核苷酸接头序列连接到单链cDNA的3'末端采用T4 RNA连接酶试剂盒进行。
7.根据权利要求1所述的基于高通量测序技术的全血免疫组库探测方法,其特征在于:步骤(2)所述通用引物序列为GCG GCC GCT TAT TAA CCC。
8.根据权利要求1所述的基于高通量测序技术的全血免疫组库探测方法,其特征在于:步骤(2)所述PCR反应条件为:93℃-97℃下变性2min-3min,68℃-72℃下退火延伸4min-6min,加入特殊靶向引物P-VDJ后63℃-67℃下退火,68℃-72℃下延伸,30-40个循环。
9.根据权利要求1所述的基于高通量测序技术的全血免疫组库探测方法,其特征在于:步骤(2)所述高通量测序采用IIIumina的HiSeq-2500测序器。
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