[发明专利]一种Poly (A)聚合酶活性测定方法无效
申请号: | 201410502196.4 | 申请日: | 2014-09-28 |
公开(公告)号: | CN104357543A | 公开(公告)日: | 2015-02-18 |
发明(设计)人: | 徐晓昱 | 申请(专利权)人: | 南京诺唯赞生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/48 | 分类号: | C12Q1/48 |
代理公司: | 南京正联知识产权代理有限公司 32243 | 代理人: | 王素琴 |
地址: | 210014 江苏省*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 poly 聚合 活性 测定 方法 | ||
技术领域
本发明属于生化技术领域,具体来说涉及一种Poly (A)聚合酶活性测定方法。
背景技术
Poly(A)聚合酶(Poly(A)polymerase,PAP)是一种特殊的RNA聚合酶。该酶可不依赖模板特异性的催化三磷酸腺甘(ATP),逐个聚合至单链RNA片段的3’-OH端上,其反应方程式为:
PAP是基因工程技术,特别是microRNA研究中一种重要的工具酶。microRNA是一种长度在21nt左右的单链RNA,没有成熟的mRNA中常见的poly A尾巴。PAP可以在microRNA的3’-OH末端加上长度不一的poly A尾巴,这样就可以universal-oligo dT为引物与加上的poly A尾巴结合进行逆转录;再用特异的正向引物与universal反向引物进行PCR,从而实现microRNA的检测,其原理如图1所示。
PAP加尾反应是上述流程的第一步,也是最关键的步骤。因此,准确测定PAP酶的活性,保证批次活性的稳定性,对于microRNA检测试剂盒的性能和质量具有至关重要的意义。
标准的PAP酶活力测定法采用放射性底物掺入法,即采用以3H标记的ATP为底物,经PAP催化使其掺入到oligo(rA)15上,其反应式如下:
通过测定酸不溶性产物中放射性同位素的量,计算出PAP酶的活性。这种方法关键在于掺入产物和标记ATP的分离。三氯乙酸TCA可使oligo(rA)15沉淀,而标记的ATP不被沉淀;将TCA处理的产物加在whatman滤纸上,就可以实现掺入产物和标记ATP的分离。再经过洗涤、干燥、洗脱,最后测定放射性同位素或者荧光强度。因此,“掺入法”存在易产生放射性污染、步骤多、周期长的 缺陷,难以实现高通量、自动化。
发明内容
本发明的目的是建立一种简便、快速、非放射性的PAP酶测活方法。本发明摈弃了传统的“掺入法”,采用了一种全新的“转化法”,其原理如图2所示。
具体来说,本发明采用了以下技术方案:
一种Poly (A)聚合酶活性测定方法,其特征在于,所述方法包括:首先根据单链模板合成引物,然后进行PAP酶催化的加尾反应,反应完成后与单链模板退火,随后在足量没有3’-5’外切酶活性的DNA聚合酶存在下进行聚合反应生成双链DNA,最后测定聚合反应完成后反应体系中双链DNA的相对量,并由该检测结果推导出Poly (A)聚合酶活性程度,其中所用单链模板上引物3’方向上第一位的碱基不是t。
优选地,反应体系中双链DNA的相对量是利用荧光染料,例如仅与双链DNA或仅与单链DNA结合的荧光染料,利用荧光法检测得到的,并且双链DNA的相对量是以荧光强度表示的。
在一个实施方案中,所采用的荧光染料是双链DNA特异性荧光染料。更优选,所采用的荧光染料是picogreen染料。
优选地,所采用的单链模板是单链环状DNA模板。更优选,所采用的单链模板是M13噬菌体单链DNA。因此,在一个实施方案中,所用的引物是5’-aagccatccgcaaaaatgacctct-3’。并且据此可以建立一套标准的测定方法。
在一个实施方案中,所采用的DNA聚合酶是Klenow DNA聚合酶exo-突变体,即突变致使3’-5’外切酶活性缺失的Klenow大片段。
本发明的优点:
1. 无放射性污染;
2. 操作步骤简单快速,无需TCA沉淀、洗涤、干燥、洗脱步骤;可实现高通量、自动化的活性测定。
3. 灵敏度高,可检测到0.1 U的PAP活性。
附图说明
图1是采用PAP测定microRNA的原理图。
图2是本发明的Poly (A)聚合酶活性测定方法的原理图。
图3是本发明方法的一个实施例中PAP活性与荧光强度的关系图。
图4是本发明方法的另一个实施例中PAP活性与荧光强度的关系图。
具体实施方式
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