[发明专利]一种鱼类精巢组织总RNA的提取方法在审
申请号: | 201410505252.X | 申请日: | 2014-09-26 |
公开(公告)号: | CN104212796A | 公开(公告)日: | 2014-12-17 |
发明(设计)人: | 杨晓飞;徐绍刚;李文通;袁丁;杨贵强;马峻峰 | 申请(专利权)人: | 北京市水产科学研究所 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 | 代理人: | 王文君 |
地址: | 100068*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 鱼类 精巢 组织 rna 提取 方法 | ||
技术领域
本发明涉及鱼类总RNA的提取,具体地说,涉及一种鱼类精巢组织总RNA的提取方法。
背景技术
总RNA分离纯化技术是分子生物学研究技术的基础,从组织中提取纯度稳定、完整性好、重复性高、无污染的总RNA的分离纯化方法,是决定后续实验结果质量的关键,一些特定的部位使用通用的RNA分离纯化方法,往往不能满足要求,需要相应的处理与提取制备方法。
鱼类精巢组织内含有大量的蛋白成分(精原细胞、精母细胞和精子等)和结缔组织,采用常规RNA分离纯化方法,在抽提的过程中容易蛋白污染,而且操作过程中样本不易研磨,裂解时易产生粘稠胶团,造成抽提过程中RNA的降解和得率偏低。由于存在上述问题,使鱼类精巢组织总RNA难以稳定的分离和纯化。
目前,有针对性的分离纯化鱼精巢组织总RNA的方法较少,用传统方法处理鱼精巢组织研磨不充分、裂解易形成粘稠胶团、提取的总RNA浓度低、稳定性差、污染率高,无法满足后续实验的要求。
发明内容
为了解决现有技术中存在的问题,本发明的目的是提供一种适用于鱼类精巢组织总RNA的提取方法。
为了实现本发明目的,本发明采用如下技术方案:
一种鱼类精巢组织总RNA的提取方法,具体为:将鱼类精巢组织经液氮速冻,Trizol裂解液处理后匀浆、过滤、离心,经蛋白酶K消化、氯仿-正丁醇混合液萃取后,再经异丙醇-醋酸钠沉淀,DNA酶处理后,经洗涤而获得鱼类精巢组织总RNA。
进一步地,所述Trizol裂解液使用前加入β-巯基乙醇和/或8-羟基喹啉,使其在所述Trizol裂解液中的体积浓度分别为1.0-2.5%和0.10-0.15%。由于Trizol裂解液本身含有0.10%的8-羟基喹啉,因此也可不再加入8-羟基喹啉。但为了更好的抑制内源RNA酶活性,减少RNA的降解,还可有效的排除核蛋白、色素等物质的干扰,在Trizol裂解液使用前加入0.05%8-羟基喹啉,使其在Trizol裂解液中的体积浓度达到0.15%。
进一步地,所述过滤使用35-40目滤网过滤。
作为优选,所述氯仿-正丁醇混合液使用量为1/4Trizol体积。
进一步地,所述氯仿-正丁醇混合液中氯仿与正丁醇的体积比为24:1。
进一步地,在使用异丙醇-醋酸钠沉淀RNA前,加入RNase-free的脂质体。
进一步地,在经异丙醇-醋酸钠沉淀时,异丙醇与醋酸钠的体积比为4:1。
进一步地,所述提取方法具体包括以下步骤:
1)取鱼类精巢组织,无菌RNase-free水清洗后放入液氮中速冻,超低温冻存;
2)将冻存样本转入含有Trizol裂解液的RNase-free EP管中,匀浆后置于冰中,超声破碎,过滤,离心,取上清;
3)加入RNase-free水稀释,再加入蛋白酶K,振荡摇匀,离心,取上清;
4)加入氯仿和正丁醇混合液,振荡摇匀至均匀的乳白状絮状,室温静置,离心,取上清;
5)加入RNase-free的脂质体;
6)加入与步骤5)混合液等体积的异丙醇-醋酸钠混合液,振荡摇匀,离心,弃上清液;
7)用预冷的乙醇悬浮沉淀,离心,弃去乙醇,晾干,加入RNase-free水充分溶解;
8)加入RNase-free DNase缓冲液、RNase-free DNA酶、RNA酶抑制剂和RNase-free水,处理40-50min,得到DNA酶处理液;
9)加入乙二胺四乙酸,加热处理灭酶活,随后依次加入RNase-free水、醋酸钠和预冷的无水乙醇,混匀后放置15-25min,离心,弃上清;
10)用预冷的乙醇洗涤沉淀,离心,弃上清,室温封闭静置5-10min,晾干,加入RNase-free水或0.5%的SDS溶液充分溶解,-80℃保存。
更进一步地,所述提取方法具体包括以下步骤:
1)取60-80mg鱼类精巢组织,无菌RNase-free水清洗后迅速放入液氮中速冻,-80℃超低温冻存;
2)将冻存样本迅速转入含有1ml Trizol裂解液的RNase-free EP管中,使用RNase-free电动匀浆器匀浆,将EP管放置于冰中,超声破碎8-10s,间隔15-20s,超声破碎8-10s,使用35-40目过滤网过滤一次,17000-19000g 4℃离心5min,取上清;
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