[发明专利]用于猕猴桃杂交群体雌雄性别鉴定的SSR分子标记A002有效
申请号: | 201410524999.X | 申请日: | 2014-09-30 |
公开(公告)号: | CN104313019B | 公开(公告)日: | 2017-05-03 |
发明(设计)人: | 黄宏文;张琼;钟彩虹;龚俊杰;刘春燕 | 申请(专利权)人: | 中国科学院武汉植物园 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/68 |
代理公司: | 武汉宇晨专利事务所42001 | 代理人: | 黄瑞棠 |
地址: | 43007*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 猕猴桃 杂交 群体 雌雄 性别 鉴定 ssr 分子 标记 a002 | ||
1.一种用于猕猴桃杂交群体雌雄性别鉴定的SSR分子标记A002,其特征在于:
SSR分子标记A002的扩增引物序列如SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.4所示;
扩增得到的雄株特异片段核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示;
扩增得到的雌株特异片段核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。
2.按权利要求1所述的SSR分子标记A002的获得方法,其特征在于包括下列步骤:
①构建猕猴桃高密度遗传图谱;
②收集性别表型转换为表型标记;
③在遗传图谱上定位表型标记;
④在基因组序列上确定性别决定区间
整理性别表型标记附近的SNP分子标记A002,将SNP标记A002的核苷酸序列比对到猕猴桃基因组序列;比对结果显示性别表型标记邻近的SNP标记均来自于第25号染色体上,具体位置在2Mb附近;因此,将猕猴桃性别相关区段锁定在第25号染色体的1.5-2.5Mb区间内;
⑤筛选性别决定区间内SSR标记提取猕猴桃基因组第25号染色体上1.5-2.5Mb区间的核苷酸序列,搜索到有功能的简单重复序列30个;利用Primer5.0软件,针对简单重复序列设计扩增引物;利用设计合成的引物,对猕猴桃雌株和雄株进行PCR扩增,摸索合适的扩增条件,保证扩增条带的清晰度和稳定性;筛选得到本分子标记能在雄株和雌株中各扩增得到一条特征谱带。
3.按权利要求1所述的SSR分子标记A002的扩增引物SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.4在山梨猕猴桃和中华猕猴桃‘桂海4号’杂交群体中进行雌雄性别鉴定的应用。
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