[发明专利]用于猕猴桃杂交群体雌雄性别鉴定的SSR分子标记A002有效

专利信息
申请号: 201410524999.X 申请日: 2014-09-30
公开(公告)号: CN104313019B 公开(公告)日: 2017-05-03
发明(设计)人: 黄宏文;张琼;钟彩虹;龚俊杰;刘春燕 申请(专利权)人: 中国科学院武汉植物园
主分类号: C12N15/11 分类号: C12N15/11;C12Q1/68
代理公司: 武汉宇晨专利事务所42001 代理人: 黄瑞棠
地址: 43007*** 国省代码: 湖北;42
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摘要:
搜索关键词: 用于 猕猴桃 杂交 群体 雌雄 性别 鉴定 ssr 分子 标记 a002
【权利要求书】:

1.一种用于猕猴桃杂交群体雌雄性别鉴定的SSR分子标记A002,其特征在于:

SSR分子标记A002的扩增引物序列如SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.4所示;

扩增得到的雄株特异片段核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示;

扩增得到的雌株特异片段核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。

2.按权利要求1所述的SSR分子标记A002的获得方法,其特征在于包括下列步骤:

①构建猕猴桃高密度遗传图谱;

②收集性别表型转换为表型标记;

③在遗传图谱上定位表型标记;

④在基因组序列上确定性别决定区间

整理性别表型标记附近的SNP分子标记A002,将SNP标记A002的核苷酸序列比对到猕猴桃基因组序列;比对结果显示性别表型标记邻近的SNP标记均来自于第25号染色体上,具体位置在2Mb附近;因此,将猕猴桃性别相关区段锁定在第25号染色体的1.5-2.5Mb区间内;

⑤筛选性别决定区间内SSR标记提取猕猴桃基因组第25号染色体上1.5-2.5Mb区间的核苷酸序列,搜索到有功能的简单重复序列30个;利用Primer5.0软件,针对简单重复序列设计扩增引物;利用设计合成的引物,对猕猴桃雌株和雄株进行PCR扩增,摸索合适的扩增条件,保证扩增条带的清晰度和稳定性;筛选得到本分子标记能在雄株和雌株中各扩增得到一条特征谱带。

3.按权利要求1所述的SSR分子标记A002的扩增引物SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.4在山梨猕猴桃和中华猕猴桃‘桂海4号’杂交群体中进行雌雄性别鉴定的应用。

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