[发明专利]一种S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶的药物口袋及其应用有效
申请号: | 201410530674.2 | 申请日: | 2014-10-10 |
公开(公告)号: | CN104357545A | 公开(公告)日: | 2015-02-18 |
发明(设计)人: | 刘森;廖陈曾 | 申请(专利权)人: | 三峡大学 |
主分类号: | C12Q1/527 | 分类号: | C12Q1/527 |
代理公司: | 宜昌市三峡专利事务所 42103 | 代理人: | 蒋悦 |
地址: | 443002*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 腺苷 甲硫氨酸 脱羧酶 药物 口袋 及其 应用 | ||
1.一种S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶的药物口袋,其特征在于:以S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶(AdoMetDC)的晶体结构为基础,将PDB ID为3DZ5的AdoMetDC晶体结构中的第68位丙酮酰基用PDB ID 1JL0的AdoMetDC晶体结构中的第68位色氨酸残基替代,以替代后的AdoMetDC晶体结构为基础,通过Pocket蛋白质药物口袋分析软件,确定在alpha亚基和beta亚基两条链之间形成的药物口袋为S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶的药物口袋。
2.根据权利要求1所述的S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶的药物口袋,其特征在于:所述的在alpha亚基和beta亚基两条链之间形成的药物口袋是在S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶上的Ser68转变成丙酮酰基之前。
3.根据权利要求1或2所述的S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶的药物口袋,其特征在于:所述的alpha亚基和beta亚基两条链是在S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶与腐胺的结合下,S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶发生自催化反应,Glu67和Ser68间的肽键断裂,形成的alpha亚基和beta亚基两条链。
4.一种S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶的药物口袋在筛选或设计或改造人源S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶的抑制剂上的应用。
5.一种S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶的药物口袋在筛选或设计或改造非人源S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶的抑制剂上的应用。
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