[发明专利]单核苷酸多态性rs73058713在检测麻风病易感基因中的应用

说明书

技术领域

本发明涉及生物技术领域中单核苷酸多态性rs73058713在检测麻风病易感基因中的应用。

背景技术

单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)指基因组单个核苷酸的变异，它是最微小的变异单元，是由单个核苷酸对置换、颠换、插入或缺失所形成的变异形式。单核苷酸多态性是基因组上高密度的遗传标志，在人类基因组中已发现的SNP数量超过3000万。作为第三代遗传标记SNP数量众多、分布密集，易于检测，因而是理想的基因分型目标。SNP分型检测在疾病基因组(如疾病易感性)，药物基因组(药效、药物代谢差异和不良反应)和群体进化等研究中具有重大意义。

目前已有多种方法可用于SNP检测,如DNA测序、限制性酶切片段长度多态性、单链构象多态性、变性高效液相色谱、SNP芯片。其中，SNP芯片包括基于核酸杂交反应的芯片、基于单碱基延伸反应的芯片、基于等位基因特异性引物延伸反应的芯片、基于“一步法”反应的芯片、基于引物连接反应的芯片、基于限制性内切酶反应的芯片、基于蛋白DNA结合反应的芯片，及基于荧光分子DNA结合反应的芯片(张小燕等。用基因芯片检测单核苷酸多态性反应原理。中国生物工程杂志。2005,25(11):52～56)。

麻风病是一种由麻风分枝杆菌感染所致的慢性传染病，在发展中国家这仍然是一个严重的健康问题，每年全球新发病例数为250000。主要侵犯皮肤和外周神经，并导致不可逆性的神经功能损害和慢性致畸致残。这已被证明在麻风的流行中环境因素和宿主遗传因素起着至关重要的作用，估计遗传因素高达57％。

世界卫生组织的方案把麻风病的临床表现分为结核型和瘤型，分别对应了Th1(细胞介导)和Th2(体液介导)组织的人体的免疫应答。麻风病多样性的临床表现反映出人体对同种病原体的两种截然不同的免疫应答，这就说明遗传易感性在麻风发病中的重要性。遗传研究的结果表明遗传与麻风易感性和其临床亚型的病情进展都有关联。

发明内容

本发明的目的是提供单核苷酸多态性rs73058713在检测与筛查麻风病中的应用。

本发明首先提供了下述A1)-A7)中的任一用途：

A1)检测人基因组中rs73058713的多态性(即等位基因)或基因型的物质在制备筛查麻风病患者产品中的应用。

A2)检测人基因组中rs73058713的多态性(即等位基因)或基因型的物质在制备检测麻风病易感性产品中的应用。

A3)检测人基因组中rs73058713的多态性(即等位基因)或基因型的物质在制备检测与麻风病相关的单核苷酸多态性的产品中的应用。

A4)检测人基因组中rs73058713的多态性(即等位基因)或基因型多态性(即等位基因)或基因型的物质在制备鉴定或辅助鉴定与麻风病相关的单核苷酸多态性的产品中的应用。

A5)人基因组中rs73058713的多态性(即等位基因)或基因型多态性(即等位基因)或基因型在制备筛查麻风病患者产品中的应用。

A6)人基因组中rs73058713的多态性(即等位基因)或基因型在制备检测麻风病易感性产品中的应用。

A7)含有检测人基因组中rs73058713的多态性(即等位基因)或基因型的物质的产品，为a)-d)中的任一种产品：

a)检测与麻风病相关的单核苷酸多态性(即等位基因)或基因型的产品；

b)鉴定或辅助鉴定与麻风病相关的单核苷酸多态性(即等位基因)或基因型的产品；

c)筛查麻风病患者产品；

d)检测麻风病易感性产品。

上述用途中，所述检测人基因组中rs73058713的多态性(即等位基因)或基因型的物质可为扩增包括rs73058713在内的基因组DNA片段的PCR引物和单碱基延伸引物。

在本发明的实施例中，所述麻风病具体为中国汉族人群及少数民族麻风病。

rs73058713是人染色体5q14.3上的一个二等位多态性的SNP位点，该变异是颠换(A/C，在其互补链上则为T/G)。所述rs73058713基因型是AA、AC或CC。所述AA是rs73058713位点为A的纯合型，所述CC是rs73058713位点为C的纯合型，所述AC是rs73058713位点为A和C的杂合型。所述检测人基因组中rs73058713的多态性(即等位基因)或基因型具体可为检测rs73058713的核苷酸种类。