[发明专利]TP1基因3’UTR区功能SNP位点及其检测引物、试剂盒和检测方法有效
申请号: | 201410531776.6 | 申请日: | 2014-10-10 |
公开(公告)号: | CN104293951A | 公开(公告)日: | 2015-01-21 |
发明(设计)人: | 鞠志花;张帅;王长法;张燕;王秀革;黄金明;李建斌;仲跻峰 | 申请(专利权)人: | 山东省农业科学院奶牛研究中心 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 济南圣达知识产权代理有限公司 37221 | 代理人: | 杨琪;崔苗苗 |
地址: | 250100 山东省*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | tp1 基因 utr 功能 snp 及其 检测 引物 试剂盒 方法 | ||
1.一种影响种公牛精液品质优劣的TP1基因3'UTR区功能SNP位点,其特征在于,所述SNP位点为:g.528G>A;核苷酸位置的编号基于GenBank登录号为AC_000159.1,在105576568与105577158之间的牛TP1基因序列,且以TP1基因的起始密码子ATG作为+1。
2.权利要求1所述的TP1基因3'UTR区功能SNP位点在筛选和鉴定种公牛是否具有优质的精液品质中的应用。
3.一种用于检测种公牛TP1基因3'UTR区功能SNP位点的引物,其特征在于,上游引物的序列如SEQ ID NO.1所示,下游引物的序列如SEQ ID NO.2所示。
4.权利要求3所述的引物在筛选和鉴定种公牛是否具有优质的精液品质中的应用。
5.一种用于检测种公牛TP1基因3'UTR区功能SNP位点基因分型的引物,其特征在于,上游引物序列如SEQ ID NO.4所示,下游引物序列如SEQ ID NO.5所示。
6.权利要求5所述的引物在筛选和鉴定种公牛是否具有优质的精液品质中的应用。
7.采用权利要求5所述的引物进行种公牛精液品质优劣筛选的方法,其特征在于,以种公牛基因组DNA为模板,利用SEQ ID NO.4和SEQ ID NO.5所示的引物对待检测的种公牛的TP1基因3'UTR区进行扩增,将PCR产物用FastDigest限制酶TaqⅠ进行切割,聚丙烯酰胺凝胶电泳检测酶切产物,并根据银染后的电泳结果进行判定:若得到283bp一条带,则为GG基因型;若得到307bp,283bp两条带,则为GA基因型;若得到307bp一条带,则为AA基因型;其中,GG基因型具有优良的精液品质性状,作为种公牛精液品质优劣筛选的分子标记。
8.一种用于种公牛精液品质优劣筛选的试剂盒,其特征在于,含有权利要求5所述的引物。
9.如权利要求8所述的用于种公牛精液品质优劣筛选的试剂盒,其特征在于,包括:上游引物10μmol/L,其序列如SEQ ID NO.4所示;下游引物10μmol/L,其序列如SEQ ID NO.5所示;上述引物能够扩增出序列如SEQ ID NO.6所示的片段;2×Taq PCR MasterMix;ddH2O;FastDigest限制酶TaqⅠ;10×FastDigest buffer。
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