[发明专利]与猪生长速度相关的SNP标记及其应用有效
申请号: | 201410557725.0 | 申请日: | 2014-10-20 |
公开(公告)号: | CN104404133A | 公开(公告)日: | 2015-03-11 |
发明(设计)人: | 张浩;张博;徐艾诗;商鹏;王志秀 | 申请(专利权)人: | 中国农业大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 | 代理人: | 王文君 |
地址: | 100193 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 生长 速度 相关 snp 标记 及其 应用 | ||
1.一种与猪生长速度相关的SNP标记,其特征在于,其位于猪LXRα基因第5外显子的201bp处,此处碱基为A的猪的生长速度显著高于此处碱基为C的猪的生长速度。
2.用于检测权利要求1所述与猪生长速度相关的SNP标记的引物,其特征在于,包括正向引物F5’-AAGAAACTGAAGCGGCAAGAG-3’和反向引物R5'-ATCGCAGAGGTCTTTAGGAGG-3'。
3.权利要求1所述与猪生长速度相关的SNP标记在鉴定快速生长的优势猪品种中的应用,其包括步骤:
1)提取待测猪的基因组DNA;
2)以待测猪的基因组DNA为模板,利用权利要求2所述引物F和R,通过PCR反应扩增出猪LXRα基因462bp片段;
3)检测PCR扩增产物,如果扩增产物序列中172bp处的碱基为A,则待测猪属于快速生长的优势猪品种。
4.根据权利要求3所述的应用,其特征在于,步骤2)中PCR反应使用的扩增体系以25μl计为:100ng/μL模板DNA1μL,5pmol/μL引物F和R各1μL,10mmol/L dNTP mix2.0μL,5U/μL Taq DNA聚合酶0.5μL,10×PCR反应缓冲液2.5μL,余量为水。
5.根据权利要求4所述的应用,其特征在于,步骤2)中PCR反应使用的条件为:95℃5分钟;95℃30秒,58℃30秒,72℃20秒,36个循环;72℃7分钟。
6.根据权利要求3所述的应用,其特征在于,步骤3)中检测PCR扩增产物采用RFLP法,具体为:用内切酶Taq I对PCR扩增产物进行酶切,并对酶切产物进行琼脂糖凝胶电泳检测,如果检测结果为两条带,则判定基因型为AA型,待测猪属于生长快速的优势猪品种;检测结果出现三条带,则判定基因型为CC型,待测猪属于普通品种;检测结果为四条带,则判定基因型为AC型,待测猪属于生长快速的优势猪品种。
7.含有权利要求2所述引物的用于检测猪生长速度的试剂盒。
8.根据权利要求7所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括dNTPs、Taq DNA聚合酶、Mg2+、PCR反应缓冲液中的一种或多种。
9.根据权利要求7或8所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括标准阳性模板。
10.权利要求1所述与猪生长速度相关的SNP标记在猪分子标记辅助育种中的应用。
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