[发明专利]抑制小鼠MACF1基因表达的shRNA序列及其应用有效
申请号: | 201410631379.6 | 申请日: | 2014-11-11 |
公开(公告)号: | CN104531700B | 公开(公告)日: | 2017-12-29 |
发明(设计)人: | 骞爱荣;商澎;胡丽芳;李润芝;苏佩红;印崇;闫琨;陈志浩;戚依朵;孙瑜隆 | 申请(专利权)人: | 西北工业大学 |
主分类号: | C12N15/113 | 分类号: | C12N15/113;C12N15/867;C12N5/10;A01K67/027 |
代理公司: | 西北工业大学专利中心61204 | 代理人: | 王鲜凯 |
地址: | 710072 *** | 国省代码: | 陕西;61 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 抑制 小鼠 macf1 基因 表达 shrna 序列 及其 应用 | ||
技术领域
本发明涉及一种shRNA序列,特别涉及一种抑制小鼠MACF1基因表达的shRNA序列。还涉及这种抑制小鼠MACF1基因表达的shRNA序列的应用。
背景技术
微管微丝交联因子1(microtubule actin crosslinking factor 1,MACF1),又名ACF7(Actin crosslinking factor 7),是一种新的细胞骨架交联分子,定位于1p31-32上,含有5380个氨基酸,通过调节微丝、微管骨架动力学,在调节细胞迁移、细胞极化、细胞粘附、细胞信号转导、蛋白质运输等多种生物学功能中起重要作用。由于MACF1的广泛分布性及其在多种生物学功能中的重要作用,因此,研究其在不同组织中的功能具有重要意义。
RNA干扰(RNA interference,RNAi)是指在进化过程中高度保守的、由双链RNA(double-stranded RNA,dsRNA)诱发的、同源mRNA高效特异性降解的现象。使用RNAi技术可以特异性沉默特定基因的表达,因此,该技术已被迅速而广泛用于特定基因功能、基因表达调控的研究及相关疾病的基因治疗研究领域。小发卡或短发卡RNA(small hairpin RNA或short hairpin RNA,shRNA)是一段具有紧密发卡环的RNA序列,通过载体可将shRNA导入细胞,导入的shRNA发卡结构被细胞机制切割成siRNA,由siRNA发挥作用达到沉默靶基因表达的作用。
文献1“Chen HJ,Lin CM,Lin CS,Perez-Olle R,Leung CL,Liem RK,The role of microtubule actin cross-linking factor 1(MACF1)in the Wnt signaling pathway,Genes Dev.20(2006)1933–1945.”报道了采用siRNA的技术方法降低了小鼠多能胚胎癌细胞系P19细胞和Rat-1稳定成纤维细胞系中MACF1的表达,并用了蛋白质免疫印迹检测了该siRNA在降低MACF1表达方面的效率,结果发现转染后这两种细胞系中MACF1的表达量降低了~65%。
文献2“Ka M,Junq EM,Mueller U,Kim WY,MACF1 regulates the migration of pyramidal neurons via microtubule dynamics and GSK-3 signaling,Developmental Biology.395(2014)4–18.”报道中使用shRNA的方法来降低MACF1的表达,同时采用电穿孔转染方法将针对MACF1的shRNA转到小鼠大脑皮质细胞中,蛋白质免疫印迹检测证明shRNA明显降低了MACF1的蛋白表达。
上述方法均在降低小鼠细胞中MACF1表达方面取得了显著的效果,但采用上述siRNA方法及电穿孔转染方法在降低小鼠前成骨细胞系中MACF1的表达时效率较低,且致死率较高,原因主要是小鼠前成骨细胞系MC3T3-E1转染较为困难。
发明内容
为了克服现有shRNA序列抑制小鼠MACF1基因表达时效率低的不足,本发明提供一种抑制小鼠MACF1基因表达的shRNA序列及其应用。抑制小鼠MACF1基因表达的shRNA序列为:5'-GCTAGTGAATATCCGCAATGATTCAAGAGATCATTGCGGATATTCA CTAGC-3',其中TTCAAGAGA为loop结构,其作用起始靶点是MACF1基因的第627位点。通过将抑制小鼠MACF1基因表达的shRNA序列克隆至pGLV3慢病毒载体上,得到含有所述shRNA序列的重组慢病毒载体;通过将所得到的重组载体用于转染小鼠细胞,达到抑制细胞中MACF1基因表达的目的。以上所述shRNA序列可明显抑制小鼠前成骨细胞中MACF1基因在mRNA及蛋白水平的表达,并且,通过抑制小鼠前成骨细胞中MACF1的表达抑制了前成骨细胞增殖、迁移和分化功能,提高了shRNA序列抑制小鼠MACF1基因表达时的效率。
本发明解决其技术问题所采用的技术方案是:一种抑制小鼠MACF1基因表达的shRNA序列,其序列结构是5'-GCTAGTGAATATCCGCAATGATTCAAGAGATCATTGCGGATATTCACTAGC-3',其中TTCAAGAGA为loop结构。
一种上述抑制小鼠MACF1基因表达的shRNA序列的应用,其特点是:
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