[发明专利]利用分子标记鉴别瓠瓜品种果实苦味的方法及其引物有效

专利信息
申请号: 201410639499.0 申请日: 2014-11-13
公开(公告)号: CN104480107B 公开(公告)日: 2016-11-30
发明(设计)人: 吴新义;吴晓花;徐沛;汪宝根;邹宜静;鲁忠富;胡耀文;李国景 申请(专利权)人: 浙江省农业科学院
主分类号: C12N15/11 分类号: C12N15/11;C12Q1/68
代理公司: 杭州丰禾专利事务所有限公司 33214 代理人: 王从友
地址: 310021 *** 国省代码: 浙江;33
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摘要:
搜索关键词: 利用 分子 标记 鉴别 品种 果实 苦味 方法 及其 引物
【权利要求书】:

1.一种与瓠瓜品种果实苦味基因连锁的InDel标记,其特征在于该InDel标记由BID50引物组和BID89引物组构成,其引物序列如下:

BID50上游引物:5’- ccatgagccaagagcca-3’;

BID50下游引物:5’- gctgtgtctcttgaagctctaa-3’;

BID89上游引物:5’- cgcttctggtttataggtttac-3’;

BID89下游引物:5’- gctaaaccaatcaaaacctaag-3’。

2.一种筛选权利要求1所述的InDel标记的方法,其特征在于该方法包括以下的步骤:

1)群体及材料准备:选择无苦味的杭州长瓜和蒲县瓠瓜杂交,其F1代植株所结的果实均呈现苦味,F2代植株果实苦与不苦出现9:7的分离;

2) 特殊BSA池构建:在F2代,选择6株果实无苦味的单株构建杂合池,;将果实出现苦味的F2代单株继续种植,鉴定其子代的果实,选择子代果实苦味不分离的F2单株建成纯合池;

3)标记筛选:利用162对InDel标记在亲本间和两池间进行多态性筛选,筛选到InDel标记BID89在纯合池中只出现和杭州长瓜一致的条带,在杂合池中同时出现了两亲本的条带;BID50在纯合池中只出现和蒲县瓠瓜一致的条带,在杂合池中同时出现两亲本的条带。

3.一种利用分子标记鉴别瓠瓜品种果实苦味的方法,其特征在于该方法包括以下的步骤:

1)DNA提取、PCR反应及电泳:DNA提取采用试剂盒,按照说明提取;PCR反应体积为12.5μl,包含10–20 ng模板DNA,1×PCR buffer,50 mM KCl,0.1 mM dNTP,0.75–1.5 mM MgCl2,0.2 μM引物,1U Taq聚合酶;所述的引物采用权利要求1所述的BID50引物组或BID89引物组,BID89引物组与BID50引物组的PCR反应程序为94℃预变性3分钟,94℃变性30秒,55℃退火40秒,72℃延伸40秒,循环35次,最后72℃总延伸5分钟,4℃保存;取3μl PCR产物在8%的非变性聚丙烯酰胺凝胶上电泳,Acr:Bis = 19:1或39:1,指示剂为二甲苯青,电泳电压为200V,电泳时间1小时,用银染法染色显带,照相后用Photoshop软件对图片进行处理,观察;

2)检测结果分析:根据电泳结果对BID50、BID89的带型进行赋值,带型与杭州长瓜一致的赋值为1,与蒲县瓠瓜一致的赋值为0,杂合带型赋值为2,赋值后的组合将出现以下情况:

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