[发明专利]一种同时检测BP、MBV、HPV的三色荧光定量PCR联合检测方法及其试剂盒在审
申请号: | 201410740793.0 | 申请日: | 2014-12-04 |
公开(公告)号: | CN104531896A | 公开(公告)日: | 2015-04-22 |
发明(设计)人: | 张晓玮;邓武 | 申请(专利权)人: | 广州维伯鑫生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68 |
代理公司: | 广州嘉权专利商标事务所有限公司 44205 | 代理人: | 郑莹 |
地址: | 510663 广东省广州市广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 同时 检测 bp mbv hpv 三色 荧光 定量 pcr 联合 方法 及其 试剂盒 | ||
1.一种同时检测对虾杆状病毒、斑节对虾杆状病毒、肝胰腺细小病毒的三色荧光定量PCR联合检测试剂盒,包括如下成分:多色荧光定量PCR MIX、病毒核酸提取液、热启动Taq酶阳性质控品、阴性质控品,其特征在于:所述多色荧光定量PCR MIX中含有同时检测对虾杆状病毒、斑节对虾杆状病毒、肝胰腺细小病毒的的特异性引物及探针,序列分别为:
对虾杆状病毒的
上游引物:BP-F:5’- AACCTGACCTCCTCCAAACTTTTA -3’(SEQ ID NO:1);
下游引物:BP-R:5’- CCCAAAATTCTAGAGCCTCCAA -3’(SEQ ID NO:2);
荧光探针:BP-P:5’- TCAGGCTGGACCAGATGTCCCAAAA -3’(SEQ ID NO:3);
斑节对虾杆状病毒的
上游引物:MBV-F:5’- TTGCTCCAAAAAGAGTTCTTCCA -3’(SEQ ID NO:4);
下游引物:MBV-R:5’- AAGGGTGTATGCTAGCCTATGGTAGT -3’(SEQ ID NO:5);
荧光探针:MBV-P:5’- CATTTCCTTTATATTCCAATCGCGTCTGCG -3’(SEQ ID NO:6);
肝胰腺细小病毒的
上游引物:HPV-F:5’-CTGGAGTAAAAGTAGCAAGAGGGTTT-3’(SEQ ID NO:7);
下游引物:HPV-R:5’-AGTCTTGCCATAGTTGCTTGTTGT-3’(SEQ ID NO:8);
荧光探针:HPV-P:5’-TCCGAGGCTACGAGAAGATCCTGCAAC-3’(SEQ ID NO:9)。
2.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于:所述多色荧光定量PCR MIX中含有5mM MgCl2,50mM Tris,100mM KCl, 400mM dNTP,0.1mg/mL GP32蛋白,400nM BP-F、400nM BP-R、400nM MBV-F、400nM MBV-R、400nM BMNV-F、400nM BMNV-R、400nM HPV-F、HPV-R,240nM BP-P、240nM MBV-P、240nM BMNV-P、240nM HPV-P。
3.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于:所述病毒核酸提取液含有50mM Tris-HCl,0.7M NaCl,10mM EDTA,1%的 CTAB和1mM的DTT。
4.一种同时检测对虾杆状病毒、斑节对虾杆状病毒、肝胰腺细小病毒的三色荧光定量PCR联合检测方法,其特征在于:包括以下步骤:
1)病毒DNA的提取;
2)多色荧光定量PCR扩增:将多色荧光定量PCR MIX 20μl与热启动Taq酶1μl混合,瞬时离心后,加入提取好待检测的DNA 4μl;同样按照上述体系设置阳性和阴性对照,加入阳性质控品或阴性质控品4μl;放入定量PCR仪器的反应槽内,设置各检测的名称和荧光基团种类,设定反应程序为:94℃ 2分钟后;94℃ 15秒,55℃ 30秒,40个循环;若使用带毛细管的仪器LightCycler,则反应程序为:为93℃ 2分钟后;93℃ 5秒 58℃ 45秒,共40个循环;
3)结果分析:根据信噪情况设定和调整基线和阈值,通过收集的荧光曲线和Ct值判定结果;
阴性质控品应无扩增曲线,阳性质控品的3种荧光Ct值小于35个循环且呈S型扩增曲线;若待测样品中对虾杆状病毒的荧光Ct值小于35个循环且呈S型扩增曲线的为对虾杆状病毒阳性,若斑节对虾病毒的荧光Ct值小于35个循环且呈S型扩增曲线的为斑节对虾病毒阳性,若肝胰腺细小病毒的荧光Ct值小于35个循环且呈S型扩增曲线的为肝胰腺细小病毒阳性。
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于:所述病毒DNA提取的具体操作为:将预处理的对虾肝胰腺标本或各期幼体标本先加入10 μL 20mg/ml蛋白酶K,56℃水浴10分钟后,再加入50μL病毒核酸提取液后,上清液即为待检测DNA样本。
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