[发明专利]生物信息项目的产品参数自动匹配方法及系统

说明书

技术领域

本发明涉及生物信息分析领域，尤其涉及一种生物信息项目的产品参数自动匹配方法及系统。

背景技术

随着生命科学领域实验技术的快速发展，科学仪器的自动化、智能化水平日益提高，数据产出能力有了质的飞跃。同时，生命科学研究对分析测试的要求无论在样品数量、分析周期、分析项目和数据准确性等方面都提出了更高的标准和要求，生物实验室产出的信息呈几何级数增长。

在传统的生物实验室中，由于数据类型多样、格式不一，数据的保存、交换、查询、分析、维护都很不方便，严重阻碍了研究人员之间的信息提交。在大规模并行测序(也叫下一代测序技术、高通量测序,英文：NGS、High-throughput Sequencing)的实验和生物信息学分析中涉及到的多种流程，如DNA文库构建，基因组测序，数据处理，结果分析，成果产出，数据共享等多个环节，每个环节有不同的技术人员参与，因此在各个环节传递或是承接中会出现信息丢失或是效率低下等等问题。尤其在生物信息学中的测序，高性能计算环节，专业测序实验室需要接受大量的测序订单项目、安排测序实验、及时处理高速产出的测序结果。

在生物信息学中的测序完成后的环节中，所有项目有相应的业务线项目组来做。业务线既做只过滤，又做标准化，又做个性化。同样要经过1.项目管理立项、2.信息人负责人审批、3.信息执行人确认，4.安排跑流程，5.报告填写，6.交付，7.项目管理沟通等过程，因此耗费了业务线的本就有限的资源。

其中，对于每一个类型项目的流程，由相应的业务线独立设置参数，每跑一次，设置一次，进行跑。存在以下的问题：1、样品个数不同导致参数设置不同；2、参数设置过程中因为样品名称等因素，大型机不识别，导致错误。

发明内容

本发明的目的提供一种生物信息项目的产品参数自动匹配方法和系统，能直接和产品类型关联起来，自动匹配下机数据的样品情况，自动寻找路径，从而减少了人为设置的可能产生的误差和每个业务线的不同标准问题。

本发明提供了一种生物信息项目的产品参数自动匹配方法，包括步骤：

步骤一：创建项目并存于业务管理系统中，每个项目包括多个子项目；并选择所述创建项目中的子项目和任务信息；所述子项目的类型包括只过滤子项目和标准化子项目；

步骤二：当所述子项目的类型为只过滤子项目，则根据选择的子项目类型和任务信息，依次从下机数据管理系统中获取对应的且经过测序仪测序后的样品数据；且每获取一个样品数据，即根据样品情况自动匹配预设的默认参数配置并运用统一的过滤标准进行过滤与分析，从而过滤不符合默认参数配置的样品数据；且待获取的所有样品数据过滤与分析完后，生成分析结果，分析结果包括子项目信息和对应的样品信息；

步骤三：当所述子项目的类型为标准化子项目时，则该子项目对应的样品在经测序仪测序的同时，对该样品创建包括过滤分析、表达谱定量分析、差异比较分析、Cluster聚类分析、靶基因预测分析、KOGO分析和碱基编辑分析中的一种或多种的标准流程分析，且在创建每个标准流程分析过程中由用户根据当前子项目的样品情况输入对应的比对参数和过滤参数；经测序仪测序完成后，根据样品情况自动匹配预设的过滤参数和比对参数对每一样品数据进行过滤和比对，从而去掉不符合比对参数的样品数据；然后再运用所创建的标准流程分析对符合过滤参数并经过比对后的每一样品数据进行分析，从而默认参数以及所述输入的比对参数运用所创建的标准流程分析对应的过滤标准对每一样品数据进行过滤与分析，从而过滤不符合默认参数以及比对参数的样品；且待所有样品数据过滤与分析完后，生成分析结果，分析结果包括子项目信息和对应的样品信息；步骤四：根据样品情况自动匹配预设的过滤/质控参数以对所述分析结果进行对比质控，若质控通过，则直接输出该分析结果；若质控不通过，且所述分析结果和质控标准的差距在阈值范围内，则重新编辑所述样品数据或过滤/质控参数后再次进行步骤二或者步骤三的过滤与分析过程，直至分析结果通过质控；若质控不通过，且所述分析结果和质控标准的差距超过阈值，则编辑所述样品且废弃相关Lane,并在所述业务管理系统中重新下单。

作为上述技术方案的改进，每个子项目的概要信息包括子项目代码、子项目名称、子项目类型、是否是只过滤、总的样品数、执行人、开始时间和结束时间、子项目状态以及子项目相关操作。