[发明专利]一种基于G-四链体荧光特性的猪瘟病毒检测方法及试剂盒在审
申请号: | 201410744990.X | 申请日: | 2014-12-09 |
公开(公告)号: | CN104611462A | 公开(公告)日: | 2015-05-13 |
发明(设计)人: | 王毅;邓明刚;鲁小璐 | 申请(专利权)人: | 贵州大兴农业科技发展有限公司;王毅 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12R1/93 |
代理公司: | 贵阳东圣专利商标事务有限公司 52002 | 代理人: | 袁庆云 |
地址: | 550201 贵州*** | 国省代码: | 贵州;52 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 四链体 荧光 特性 猪瘟 病毒 检测 方法 试剂盒 | ||
1.一种基于G-四链体荧光特性的猪瘟病毒检测方法,包括以下步骤:
(1)NASBA扩增: 将纯化好的猪瘟病毒RNA样品加入到NASBA反应缓冲液体系中,体系包括0.5-1μM正向引物和0.5-1μM反向引物;
反应步骤:65℃ 变性后降温,然后加入NASBA酶反应液进行等温扩增反应,条件为: 41℃90分钟,得到RNA扩增产物;
其中:NASBA反应缓冲液体系包括NASBA反应缓冲液、NASBA正向引物和反向引物;
NASBA反应缓冲液,包括:30-60mM Tris-HCl(PH8.0); 60-80mM KCl;10-30mM MgCl2;0.5-2mM脱氧核糖核苷三磷酸(dNTPs); 0.5-2mM 核糖核苷三磷酸(NTPs);5-20mM 二硫苏糖醇;5-20%(v/v) 二甲基亚砜(DMSO);
NASBA正向引物和反向引物,包括,0.5-1μM正向引物(E2P7f): ACTATGAGCCCAGGGACAG CTACTT;0.5-1μM反向引物(E2P7T7r):GTCGACTAATACGACTCACTATAGGGTTCCCTATCAAC ACTACCTCACCC T;
NASBA酶反应液,包括:T7RNA聚合酶40-80U;AMV逆转录酶2-10U;RNA酶(RNAseH) 0.05-0.15U,0.5-5μg的牛血清白蛋白(BSA) ;
(2)G-四链体荧光检测反应:取G-四链体荧光检测反应缓冲液,反应缓冲液的组成包括上游探针0.5-2μM和下游探针0.5-2μM,加无菌双蒸水补足为96μl,加入2μl的RNA扩增产物;然后85℃变性3 min后降温;加入原卟啉0.5-2μM,然后将溶液转移到96孔酶标板中,将酶标板放入酶标仪,以399nm波长的光源激发,检测610nm波长处发射的荧光;检测到的荧光强度高于3.0×107U即可判断为猪瘟病毒阳性国;
其中:G-四链体反应缓冲液的组成包括:10mM 的4-羟乙基哌嗪乙磺酸, 200mM的氯化钠和20mM的氯化钾;上游探针0.5-2μM和下游探针0.5-2μM。
2.如权利要求1所述的一种基于G-四链体荧光特性的猪瘟病毒检测方法,其中:G-四链体反应缓冲液中的上、下游探针包含4段GGG序列,该序列又被拆分为两个部分:一个部分包含3段GGG序列,另一部分包含1段GGG序列,拆分模式是3:1。
3.如权利要求1或2所述的一种基于G-四链体荧光特性的猪瘟病毒检测方法,其中:G-四链体反应缓冲液中的探针包括,上游探针(E2- -A):GCTGATAGTGACCTACATTGGGTTGGGTTGGG;下游探针(E2--B):TGGGTGTTCTAACAGAAC AACTC。
4.一种基于G-四链体荧光特性的猪瘟病毒检测用试剂盒,其组成为:
(1) NASBA反应缓冲液包括:30-60mM Tris-HCl(PH8.0); 60-80mM KCl;10-30mM MgCl2;0.5-2mM脱氧核糖核苷三磷酸(dNTPs); 0.5-2mM 核糖核苷三磷酸(NTPs);5-20mM 二硫苏糖醇;5-20%(v/v) 二甲基亚砜(DMSO);
(2)NASBA正向引物和反向引物包括,0.5-1μM正向引物(E2P7f): ACTATGAGCCCAGGGACAG CTACTT;0.5-1μM反向引物(E2P7T7r):GTCGACTAATACGACTCACTATAGGGTTCCCTATCAAC ACTACCTCACCC T;
(3)NASBA酶反应液包括:T7RNA聚合酶40-80U;AMV逆转录酶2-10U;RNA酶(RNAseH) 0.05-0.15U,0.5-5μg的牛血清白蛋白(BSA) ;
(4)G-四链体反应缓冲液中的上、下游探针包含4段GGG序列,该序列又被拆分为两个部分:一个部分包含3段GGG序列,另一部分包含1段GGG序列,拆分模式是3:1;
(5)G-四链体反应缓冲液中的探针包括,上游探针(E2--A):GCTGATAGTGACCTACATTGGGTTGGGTTGGG;下游探针(E2--B):TGGGTGTTCTAACAGAAC AACTC;
(6)G-四链体反应缓冲液的组成包括:10mM 的4-羟乙基哌嗪乙磺酸, 200mM的氯化钠和20mM的氯化钾;上游探针0.5-2μM和下游探针0.5-2μM。
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