[发明专利]一种埃博拉病毒一步法核酸定量RT-PCR检测试剂盒在审
申请号: | 201410836939.1 | 申请日: | 2014-12-24 |
公开(公告)号: | CN105779647A | 公开(公告)日: | 2016-07-20 |
发明(设计)人: | 迟大利;吴大治;夏懿 | 申请(专利权)人: | 上海星耀医学科技发展有限公司;上海复星医药(集团)股份有限公司 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12R1/93 |
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地址: | 201315 上海*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 埃博拉 病毒 一步法 核酸 定量 rt pcr 检测 试剂盒 | ||
1.一种埃博拉病毒一步法核酸定量RT-PCR检测试剂盒,其特征在于:本发明通过考察已知EBV基因组全序列,并根据检索所得EBV不同基因亚型一致性保守序列设计出一对EBV通用定量引物、一条EBV特异性荧光探针,及一对内参特异性引物和一条内参探针,采用实时荧光定量PCR方法扩增目的基因。
2.权利要求1所述的埃博拉病毒一步法核酸定量RT-PCR检测试剂盒,其特征在于:EBV基因特异性定量序列和内参基因序列分别为:
〈SEQIDNo.1〉
5’-CCATTGCAAAATTAGAGGATGTAGATGTGTCTGATTATCCTGACCCGAGTGATATTCTTAAGATATACAATGCTGGAGACTATGTAATATCTATTCTTGGCTCAGAGGGTTATAAGATAATAAAGTACCTTGAACCA-3’,
〈SEQIDNo.2〉
5’-CATTGCTTCCATTGATGGCTTAAAGGACACCACCAATTGGTTCCTCTCTGTGCACAGGCTAATTTTTTAGGGAAAATCTGGCCTTCCCACAAGGGGAGGCCAGGGAATTTTCTTCACGTGCGCTGCYGAAGATCAAA-3’,
EBV一步法核酸定量RT-PCR检测试剂盒中核酸定量扩增基因序列全长137bp,属EBV基因组中VP30结构基因区,为单拷贝序列;内参基因序列全长137bp,与EBV核酸扩增基因序列有所不同。
3.如权利要求1所述的埃博拉病毒一步法核酸定量RT-PCR检测试剂盒,一对EBV核酸通用定量引物序列中的一条序列与SEQIDNo.1中所示的序列相同,另一条引物序列与SEQIDNo.1中所示的序列互补;EBV核酸定量特异性探针与SEQIDNo.1中所示的序列相同;内参特异性引物序列中的一条序列与SEQIDNo.2中所示的序列相同,另一条引物序列与SEQIDNo.1中所示的序列互补;内参特异性探针与SEQIDNo.2中所示的序列相同。其中,所述的一对EBV核酸通用定量引物,其序列可以选自SEQIDNo.3和SEQIDNo.4,
〈SEQIDNo.3〉为:5’-CCATTGCAAAATTAGAGGATGT-3’,
〈SEQIDNo.4〉为:5’-TGGTTCAAGGTACTTTATTAT-3’;
一对EBV核酸通用定量引物序列也可以是上述序列向前或向后延伸10~20个核苷酸的序列,或者和上述序列同源性大于85%以上;所述的EBV核酸定量特异性探针,可以选自SEQIDNo.5的序列,
〈SEQIDNo.5〉为:5’-FAM-CTGATTATCCTGACCCGAGTGATATT-BHQ-3’,
其中,探针5’-端标记FAM荧光基团,探针3’-端均标记淬灭基团。EBV核酸定量特异性探针序列也可以是上述序列向前或向后延伸10~20个核苷酸的序列,或者和上述序列同源性大于85%以上;所述的一对内参特异性引物,其序列可以选自SEQIDNo.6和SEQIDNo.7,
〈SEQIDNo.6〉为:5’-CATTGCTTCCATTGATGGCTTA-3’,
〈SEQIDNo.7〉为:5’-TTTGATCTTCRGCAGCGCACG-3’;
一对内参特异性引物序列也可以是上述序列向前或向后延伸10~20个核苷酸的序列,或者和上述序列同源性大于85%以上;所述的内参特异性探针,可以选自SEQIDNo.8的序列,
〈SEQIDNo.8〉为:5’-JOE-CCACCAATTGGTTCCTCTCTGTGCAC-BHQ-3’,
其中探针5’-端标记JOE荧光基团,探针3’-端均标记淬灭基团。内参基因序列也可以是上述序列向前或向后延伸10~20个核苷酸的序列,或者和上述序列同源性大于85%以上。
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