[发明专利]一种细菌耐药性筛查PCR芯片有效
申请号: | 201410856255.8 | 申请日: | 2014-12-31 |
公开(公告)号: | CN104531877A | 公开(公告)日: | 2015-04-22 |
发明(设计)人: | 雷向东 | 申请(专利权)人: | 南京安阔医疗科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 无 | 代理人: | 无 |
地址: | 210032 江苏省南京市高新技术*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 细菌 耐药性 pcr 芯片 | ||
1.一种细菌耐药性筛查PCR芯片,包括PCR载体及分别用于扩增与细菌耐药相关的基因的扩增引物对,所述与细菌耐药相关的基因包括:
氨基糖苷乙酰转移酶相关基因:aacA,aacA1,aacA4,aacA7,aacA29b,aacC1,aacC2,aacC3,aacC4,aac(3)-Id;
氨基糖苷腺苷转移酶相关基因:aadA4,aadA7,aadA9,aadA10,aadA12,aadD;
氨基糖苷磷酸转移酶相关基因:aph,aphA,aphA-3,aphA-6,aphA-7,aph2,aph(29)-Ib,strA;
β内酰胺酶相关基因:ctx-m4,ctx-m26,ctx-m27,ctx-m32,ges-3,kpc-3,per-1,per-2,shv-34,blaTEM-1,blaTLA-1,blaTLA-2,imp-2,imp-5,imp-9,imp-13,imp-16,vim-4,vim-7,ampC,cmy-9,cmy-13,blanps-1,blanps-2,oxa-1,oxa-2,oxa-5,oxa-9,oxa-10,oxa-12,oxa-18,oxa-20,oxa-22,oxa-27,oxa-29,oxa-40,oxa-45,oxa-46,oxa-48,oxa-50,oxa-54,oxa-55,oxa-58,oxa-60,oxa-61,oxa-75;
氯霉素酰基转移酶相关基因:cat,cat2,catIII,catA,catB2,catB4,catB6,catB7,catB8,catB9,catP;
氯霉素/氟洛芬转运蛋白相关基因:cmlA1,cmxA,fexA,floR;
疏水性多肽相关基因:cmlB;
五肽家族蛋白相关基因:qnrA3,qnrB1,qnrB4,qnr;
rRNA腺嘌呤N6-甲基转移酶相关基因:ermA,ermB,ermD,ermF,erm(TR);
酯酶相关基因:ereA2,ereB;
MFS外输泵相关基因:mefA,mefE,mel;
大环内酯29-磷酸转移酶相关基因:mph(B),mph(A),mph,mphB,mph(BM);
水解酶相关基因:vgh(A);
链阳菌素B内酯酶相关基因:vgbB;
ADP-核糖基转移酶相关基因:arr2;
四环素转运蛋白相关基因:tet(A),tetA(C),tetA(J),tetBSR,tet(D),tet(G),tet(H),tet(L),tetA(Y),tet(Z),effJ,tet(V),tet(K),tet(30),tet(33),tet(38);
四环素失活蛋白相关基因:tet(37),tet(X);
GTP关联延伸因子相关基因:tetB(P),tet(M),tet(O),tet(S),tet(W);
核糖体保护蛋白相关基因:tet(36),tetQ,tet(T);
四环素阻遏蛋白相关基因:tetR(31);
四环素抵抗相关基因:tet(U);
转磷酸核糖基酶相关基因:tet(34);
二氢叶酸还原酶相关基因:dfrII,dfrV,dfrVI,dfrXII,dfr13,dfr16,dfr17,dfrA19,dfrB2,dfrD,dhfr,dhfR,dhfrI,dhfrVIII,dhfrIX,dhfrXV;
二氢蝶酸合成酶相关基因:sulI,sulII,sulIII;
小型多药外输泵相关基因:qacB,qacD,qacED1,qacF,qacF,qacG,qacG2,qacH;
多药外输泵相关基因:acrB,acrD,mexB,mexD,mexF,mexI,mexY,orfll。
2.如权利要求1所述的细菌耐药性筛查PCR芯片,其特征在于,所示扩增引物对的序列分别为SEQ ID NO:1-380所示的核苷酸序列。
3.如权利要求1所述的细菌耐药性筛查PCR芯片,其特征在于,所述扩增引物对分别成对存在于384孔PCR板的孔中。
4.如权利要求1所述的细菌耐药性筛查PCR芯片,其特征在于,所述扩增引物对分别成对存在于两块96孔PCR板的孔中。
5.如权利要求1所述的细菌耐药性筛查PCR芯片,其特在在于,所述引物对可以单次或重复出现的方式分别成对存在于各种类型的集成化PCR载体中,即一块集成化PCR载体可以检测单个或多个样本,具体样本量可根据实际需求与PCR载体的容量来确定。
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