[发明专利]用于核酸纯化的一步程序有效
申请号: | 201480014153.X | 申请日: | 2014-03-14 |
公开(公告)号: | CN105120986B | 公开(公告)日: | 2019-03-12 |
发明(设计)人: | G.J.冈林 | 申请(专利权)人: | 雅培分子公司 |
主分类号: | B01D57/02 | 分类号: | B01D57/02;C07H1/06;C12N15/10;G01N27/447;C07H21/00 |
代理公司: | 中国专利代理(香港)有限公司 72001 | 代理人: | 李唐;吕彩霞 |
地址: | 美国伊*** | 国省代码: | 美国;US |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 核酸 纯化 一步 程序 | ||
1.一种从核酸样品中去除裂解缓冲液组分的方法,所述方法包括:
a)提供包含或怀疑包含核酸的样本,
b)使所述样本与一种或多种裂解试剂接触以产生裂解的样本,
c)在适合于所述样本中的核酸与固体基材结合的条件下,使所述样本与所述固体基材接触一段时间以产生具有固体基材结合的核酸的裂解的样本,其中所述固体基材是磁性微粒,
d)将所述具有固体基材结合的核酸的裂解的样本置于容器中,将水基分离凝胶在所述具有固体基材结合的核酸的裂解的样本上分层,和进一步将缓冲液在所述水基分离凝胶上分层,和
e)如果核酸存在于所述样本中,则使结合有核酸的所述固体基材经过水基分离凝胶进入缓冲液。
2.权利要求1的方法,其中所述裂解缓冲液含有浓度大于1摩尔的盐。
3.权利要求1的方法,其中所述固体基材是直径0.1 nm至5 nm的微粒。
4.权利要求3的方法,其中所述固体基材是直径0.8 nm至5 nm的微粒。
5.权利要求1的方法,其中在经过水基分离凝胶后,使与所述固体基材结合的所述核酸与洗脱缓冲液接触,所述洗脱缓冲液从所述固体基材中洗脱核酸。
6.权利要求5的方法,其中所述方法不包括所述核酸在有机溶剂中的沉淀。
7.权利要求5的方法,其中所述方法的确包括所述核酸在有机溶剂中的沉淀,并且所述有机溶剂为乙醇。
8.权利要求1的方法,其中在经过水基分离凝胶后,使与所述固体基材结合的所述核酸与酶接触。
9.权利要求8的方法,其中所述酶为DNA聚合酶或逆转录酶。
10.权利要求8的方法,其中所述核酸在所述固体基材上进行测序,而无需稀释。
11.权利要求1的方法,其中在经过水基分离凝胶后,使与所述固体基材结合的所述核酸与重亚硫酸盐接触,使得将未甲基化的胞嘧啶脱氨基。
12.权利要求11的方法,其进一步包括测定所述核酸中的至少一个核碱基是否具有表观遗传修饰。
13.权利要求1的方法,其中所述核酸经由选自下述的实体与所述固体基材结合:核酸杂交、适体、抗体、抗体片段、生物素、抗生物素蛋白和链霉抗生物素蛋白。
14.一种用于从样品中富集核酸的方法,所述方法包括:
a)提供:
i)怀疑包含核酸的样品,
ii)适合于结合核酸的磁性微粒,和
iii)水基分离凝胶,
b)在适合于样品中的任何核酸与磁性微粒结合的条件下,使所述样品与所述磁性微粒接触一段时间,以产生装载的磁性微粒;
c)将所述装载的磁性微粒置于容器中,将水基分离凝胶在所述装载的磁性微粒上分层,和进一步将缓冲液在所述水基分离凝胶上分层;和
d)用磁场将所述装载的磁性微粒拉动通过所述水基分离凝胶进入缓冲液。
15.权利要求14的方法,其中所述水基分离凝胶包含琼脂糖。
16.权利要求15的方法,其中所述琼脂糖为0.10 %至1.0 %的浓度。
17.权利要求15的方法,其中所述水基分离凝胶还包含乙醇和甘油中的一种或多种。
18.权利要求14的方法,其中所述磁性微粒包含适合于结合核酸的官能团。
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