[发明专利]使用尿的无细胞DNA评价肾状态的方法和组合物

权利要求书

1.用于评价个体的肾状态的方法，包括：

a.测定尿样中的常染色体的拷贝数；和

b.比较所述染色体的拷贝数与来自正常群体的尿样中的所述染色体的标准拷贝数，

其中拷贝数的改变预示改变的肾状态。

2.权利要求1的方法，其中经测定高于标准拷贝数的拷贝数预示受损的肾状态。

3.权利要求2方法，其中受损的肾状态包括肾损害、肾损伤、肾脏病、肾病症、肾移植物排斥或者对肾损害、肾损伤、肾脏病、肾病症或肾移植物排斥的治疗无响应。

4.权利要求1的方法，其中肾状态的评价包括测定肾脏病、肾损伤、肾移植损伤或肾移植物排斥的进程。

5.权利要求1的方法，其中肾状态的评价包括测定患有肾脏病、肾损伤、肾移植损伤或肾移植物排斥且目前正在进行或已经进行过治疗的个体中的治疗响应。

6.权利要求1的方法，其中经测定等于或低于标准拷贝数的拷贝数预示良好的肾健康。

7.权利要求1的方法，其中无细胞DNA提取自尿。

8.权利要求1的方法，其中测定提取自尿的无细胞DNA中的拷贝数。

9.权利要求1的方法，其中使用实时PCR、定量PCR或数字PCR测定拷贝数。

10.权利要求9的方法，其中使用BioMark实时PCR系统测定拷贝数。

11.权利要求1的方法，其中常染色体是染色体1。

12.权利要求11的方法，其中使用EIF2C1基因座测定染色体1的拷贝数。

13.权利要求8的方法，其中使用包含正向引物5'-GTTCGGCTTTCACCAGTCT和反向引物5'-CTCCATAGCTCTCCCACTC的引物组测定EIF2C1基因座。

14.权利要求13的方法，其中所述引物组用于实时PCR且进一步包括探针。

15.权利要求14的方法，其中所述探针包含如下的序列和报道基因：5'-HEX-CGCCCTGCCATGTGGAAGAT-BHQ1。

16.权利要求1的方法，还包括测定其它病理学和临床数据。

17.权利要求16的方法，其中该方法包括测定肌酸酐的量。

18.权利要求16的方法，其中该方法包括测定蛋白尿或cGFR。

19.权利要求16的方法，其中该方法包括进行肾活组织检查。

20.权利要求1的方法，其中所述个体是处于肾损害、肾损伤、肾脏病、肾病症、肾移植损伤或肾移植排斥的风险中的个体。

21.权利要求1的方法，其中所述个体是糖尿病患者。

22.权利要求1的方法，其中所述个体患有高血压。

23.权利要求1的方法，其中所述个体是同种异体移植物肾移植的接受者。

24.权利要求1的方法，其中所述个体处于肾移植物损伤或肾移植排斥的治疗中。

25.权利要求1的方法，其中所述个体患有至少一种急性排斥反应发作。

26.用于评价个体的肾状态的方法，包括：

a.测定尿样中的ALU重复单元数量；和

b.比较ALU重复单元数量与来自正常群体的尿样中的标准ALU重复单元数量，

其中ALU重复单元数量的改变预示改变的肾状态。

27.权利要求26的方法，其中经测定高于标准重复单元数量的ALU重复单元数量预示受损的肾状态。

28.权利要求27的方法，其中受损的肾状态包括肾损害、肾损伤、肾脏病、肾病症、肾移植物排斥或者对肾损害、肾损伤、肾脏病、肾病症或肾移植物排斥的治疗无响应。

29.权利要求26的方法，其中肾状态的评价包括测定肾脏病、肾损伤、肾移植损伤或肾移植物排斥的进程。