[发明专利]神经胶质瘤和肿瘤亚群中TERT启动子突变在审
申请号: | 201480019547.4 | 申请日: | 2014-02-18 |
公开(公告)号: | CN105683391A | 公开(公告)日: | 2016-06-15 |
发明(设计)人: | H·严;B·沃格尔斯坦;N·帕帕佐普洛斯;K·W·肯斯勒;Y·焦;C·贝蒂加高达;D·D·比格纳 | 申请(专利权)人: | 杜克大学;约翰·霍普金斯大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/12 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 赵蓉民;陆惠中 |
地址: | 美国北卡*** | 国省代码: | 美国;US |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 神经 胶质 肿瘤 亚群中 tert 启动子 突变 | ||
1.测试人核酸样本的方法,包括:
测试取自人的核酸样本并且确定在端粒酶逆转录酶(TERT)基因启动子中体细胞突变 的存在,其中所述核酸来自选自肉瘤、肝细胞癌、尿道癌、头颈癌、成神经管细胞瘤、神经胶 质瘤、星形细胞瘤、少突神经胶质瘤和少突星形细胞瘤的癌症。
2.权利要求1所述的方法,其中所述癌症是肉瘤。
3.权利要求1所述的方法,其中所述癌症是肝细胞癌。
4.权利要求1所述的方法,其中所述癌症是头颈癌。
5.权利要求1所述的方法,其中所述癌症是成神经管细胞瘤。
6.权利要求1所述的方法,其中所述癌症是神经胶质瘤。
7.权利要求1所述的方法,其中所述癌症星形细胞瘤。
8.权利要求1所述的方法,其中所述癌症是少突神经胶质瘤。
9.权利要求1所述的方法,其中所述癌症是少突星形细胞瘤。
10.权利要求1所述的方法,其中所述癌症是尿道癌。
11.权利要求2所述的方法,其中所述癌症是粘液性脂肪肉瘤。
12.权利要求10所述的方法,其中所述癌症是膀胱上皮细胞癌。
13.权利要求10所述的方法,其中所述癌症是上尿道上皮癌。
14.权利要求4所述的方法,其中所述癌症是舌磷状细胞癌。
15.权利要求6所述的方法,其中所述癌症是原发性成胶质细胞瘤。
16.权利要求6所述的方法,其中所述癌症是星形细胞癌。
17.权利要求6所述的方法,其中所述癌症是少突神经胶质瘤。
18.权利要求6所述的方法,其中所述癌症是少突星形细胞瘤。
19.权利要求1所述的方法,其中所述核酸样本取自原发性肿瘤。
20.权利要求1所述的方法,其中通过扩增所述启动子或所述启动子的部分形成扩增子 来测试所述核酸。
21.权利要求20所述的方法,其中所述启动子的部分包括选自chr51,295,228(“228”)、 chr51,295,229(“229”)、和chr51,295,250(“250”)的至少一个核苷酸。
22.权利要求1所述的方法,其中检测选自C228T、C250T、C228A和C229A的突变。
23.权利要求20所述的方法,其中所述扩增子被测序。
24.权利要求20所述的方法,其中所述扩增子与突变特异性寡核苷酸杂交。
25.修饰的核酸探针,其包含人TERT启动子的至少18个核苷酸,其中所述18个核苷酸包 括C228A或C229A。
26.修饰的核酸引物,其包含人TERT启动子的至少18个核苷酸,其中所述18个核苷酸包 括C228A或C229A。
27.权利要求25所述的修饰的探针,其包含可探测的标记。
28.权利要求26所述的修饰的引物,其另外包含至少10个核苷酸的序列,所述序列与人 TERT启动子的18个核苷酸不相邻。
29.权利要求1所述的方法,其中在所述测试步骤之前,核酸从原发性肿瘤样本提取。
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