[发明专利]用于靶水平的计算的使用数据排除的多重数字分析

权利要求书

1.一种用于计算可扩增的核酸靶的水平的多重数字分析的方法，所述方法包括：

提供包括多个核酸靶和对每个所述核酸靶的扩增足够的试剂的混合物，其中所述多个核酸靶包括第一核酸靶；

形成分块，每个分块包括所述混合物的一部分；

扩增在所述分块中的所述多个核酸靶；

从多个所述分块收集关于所述多个核酸靶中的每个核酸靶的扩增的数据；

识别所述数据中的分块群体，每个分块群体具有所述多个核酸靶的不同核酸靶内容；

仅从所述数据的一部分计算所述第一核酸靶的水平，其中所述数据的所述部分收集自所述多个分块的仅仅子集，其中分块的所述子集排除所述分块群体中的两个或两个以上分块群体，并且其中，两个或两个以上被排除的分块群体包括在所述数据中彼此不分辨开的至少一对被排除的分块群体；以及

所述方法还包括从分块的所述子集得到第一分块计数和第二分块计数的步骤，其中计算水平的步骤使用所述第一分块计数和所述第二分块计数来执行，其中所述第一分块计数是在分块的所述子集中的分块的总数，并且其中，所述第二分块计数是在分块的所述子集中对所述第一核酸靶为阳性的分块的数量或在分块的所述子集中对所述第一核酸靶为阴性的分块的数量。

2.如权利要求1所述的方法，其中，彼此不分辨开的所述至少一对被排除的分块群体包括对所述第一核酸靶为阳性的第一分块群体和对所述第一核酸靶为阴性的第二分块群体。

3.如权利要求1所述的方法，其中，识别分块群体的步骤包括标绘所述数据以形成数据点的三个或三个以上簇的步骤，其中每个簇代表至少一个所述分块群体，其中所述数据的所述部分排除一个或多个所述簇，并且其中，一个或多个被排除簇包括由代表具有彼此不同的核酸靶内容的分块群体的至少两组重叠的数据点组成的异质簇。

4.如权利要求3所述的方法，其中，每个数据点代表从所述多个分块的每个分块检测的光的一个或多个强度值，并且其中，标绘所述数据的步骤包括关于至少一个强度轴标绘所述数据的步骤。

5.如权利要求4所述的方法，其中，标绘所述数据的步骤包括关于至少两个强度轴标绘所述数据的步骤。

6.如权利要求1所述的方法，其中，收集数据的步骤包括得到所述多个分块中的每个分块的至少一个值的步骤，并且其中，识别的步骤基于比较所述至少一个信号值与所述多个分块中的每个分块的至少一个阈值或范围。

7.如权利要求1所述的方法，其中所述多个核酸靶包括第二核酸靶，并且其中，所述数据的所述部分排除测试为对所述第二核酸靶为阳性的每个分块。

8.如权利要求7所述的方法，其中，针对所述第一核酸靶和所述第二核酸靶用同一对引物来执行扩增的步骤。

9.如权利要求7所述的方法，其中所述多个分块的子集每个包含所述第一核酸靶的至少一个拷贝和所述第二核酸靶的至少一个拷贝，并且其中，在每个分块包含所述第一核酸靶和所述第二核酸靶的拷贝的分块中，所述第二核酸靶的扩增减小所述第一核酸靶的扩增。

10.如权利要求7所述的方法，其中所述多个核酸靶包括第三核酸靶，所述方法还包括基于排除测试为对所述第三核酸靶为阳性的分块的、所述数据的仅仅一部分来计算所述第二核酸靶的水平。

11.如权利要求1所述的方法，其中所述水平是在分块的所述子集中的所述第一核酸靶的每分块拷贝的平均数，并且其中，总体上看，在没有统计误差的情况下，所述平均数被预期与在所述两个或两个以上被排除的分块群体中的第一核酸靶的每分块拷贝的平均数相同。

12.如权利要求1所述的方法，其中，识别分块群体的步骤包括识别测试为对所述多个核酸靶中的每个为阴性的分块群体的步骤。

13.如权利要求12所述的方法，其中，分块的所述子集不包括测试为对所述多个核酸靶中的每个为阴性的分块群体。

14.如权利要求1所述的方法，其中，识别分块群体的步骤包括识别在所述数据的图表中彼此不分辨开的至少一对所述分块群体的步骤。

15.如权利要求14所述的方法，其中，分块的所述子集不包括在所述数据的图表中彼此不分辨开的所述至少一对分块群体。