[发明专利]结直肠癌生物标志物有效
申请号: | 201480044484.8 | 申请日: | 2014-08-05 |
公开(公告)号: | CN105473739B | 公开(公告)日: | 2018-03-23 |
发明(设计)人: | 冯强;张东亚;唐龙清;王俊 | 申请(专利权)人: | 深圳华大基因科技有限公司;深圳华大基因研究院 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/10;G01N33/574 |
代理公司: | 中国国际贸易促进委员会专利商标事务所11038 | 代理人: | 李程达 |
地址: | 518083 广东省深圳市盐田*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 直肠癌 生物 标志 | ||
1.用于预测受试者患结肠直肠癌(CRC)风险的基因标志物集,所述基因标志物集由SEQ ID NOs:10、SEQ ID NO:14和SEQ ID NO:6所示基因组成。
2.权利要求1的基因标志物集中的基因标志物在制备用于诊断受试者是否患有结肠直肠癌(CRC)或是否具有形成结肠直肠癌(CRC)的风险的试剂盒中的用途,包括:
a)测定基因标志物集中每个基因标志物的丰度信息;和
b)利用下列公式计算样品j的指数:
Aij是样品j中基因标志物i的丰度信息,其中i表示所述基因标志物集的每一个基因标志物;
N是在CRC中富集的标志物的子集,所述子集由SEQ ID NOs:10、SEQ ID NO:14和SEQ ID NO:6示出的标志物组成;
|N|是子集中基因标志物的数目,|N|=3;
当指数大于临界值时,表明受试者患有结肠直肠癌(CRC)或有具有形成结肠直肠癌(CRC)的风险。
3.根据权利要求2所述的用途,所述丰度信息是利用测序方法对基因标志物集中每个基因标志物的相对丰度进行测定得到的。
4.根据权利要求2所述的用途,所述丰度信息是利用qPCR方法对基因标志物集中每个基因标志物的qPCR丰度进行测定得到的。
5.根据权利要求2-4任一所述的用途,所述临界值是通过受试者工作特征(ROC)的方法获得的,其中所述临界值是ROC曲线的曲线下面积(AUC)达到最大值时对应的值。
6.根据权利要求5所述的用途,所述临界值为-14.39。
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