[发明专利]用于染色体定位的方法和组合物

权利要求书

1.一种用于确定第一染色体上至少三个基因座的排列的方法，所述 方法包括：

a.获得包含所述第一染色体的多核苷酸片段的样品；

b.对所述第一染色体的多核苷酸片段分区；

c.扩增来自所述第一染色体的多核苷酸片段的至少三个基因座，从而 产生所述第一染色体的至少三个扩增的基因座；

d.用一组至少三个探针检测所述第一染色体的至少三个扩增的基因 座，其中所述至少三个探针的每一个包括不同的标记；

e.确定所述第一染色体的至少三个基因座间的连锁频率；和

f.基于所述连锁频率，确定所述第一染色体上的所述至少三个基因座 的排列。

2.如权利要求1所述的方法，其中确定所述至少三个基因座的排列 包括确定所述至少三个基因座的第一基因座和第二基因座之间的距离。

3.如权利要求2所述的方法，其中确定所述至少三个基因座的排列 包括确定所述至少三个基因座的第二基因座和第三基因座之间的距离。

4.如权利要求3所述的方法，其中确定所述至少三个基因座的排列 包括确定所述至少三个基因座的第一基因座和第三基因座之间的距离。

5.如权利要求2-4中任一项所述的方法，其中所述距离是相对距离。

6.如权利要求2-4中任一项所述的方法，其中所述距离通过将所述连 锁频率与标准比较确定。

7.如权利要求6所述的方法，其中所述标准基于被已知距离分隔的 分子的连锁频率。

8.如权利要求1所述的方法，其中确定所述至少三个基因座的排列 包括确定所述第一染色体上第一基因座、第二基因座和第三基因座的顺 序。

9.如权利要求1所述的方法，所述方法还包括用第二组至少三个探 针检测所述第一染色体的多个扩增的基因座，其中所述第一组探针的第一 探针与第一基因座退火，所述第一组的第二探针与第二基因座退火，所述 第二组的第一探针与第一基因座退火，且所述第二组探针的第二探针与第 二基因座退火。

10.如权利要求9所述的方法，其中所述第一组探针的第三探针与第 三基因座退火，且所述第二组探针的第三探针与第四基因座退火，其中所 述第三基因座与所述第四基因座不同。

11.如权利要求1所述的方法，所述方法还包括用至少两组各至少三 个探针检测所述第一染色体的所述至少三个扩增的基因座，其中每组中的 每个探针包含不同的标记。

12.如权利要求11所述的方法，其中每一组探针包含具有相同标记的 探针。

13.如权利要求11所述的方法，其中每一组探针包含至少三个探针， 其中一组中的每个探针包含不同的标记。

14.如权利要求11所述的方法，其中所述至少两组探针中的每个探针 与不同的基因座退火。

15.如权利要求11所述的方法，其中第一组至少三个探针包括与第二 组至少三个探针中的至少一个探针相同的基因座退火的至少一个探针。

16.如权利要求11所述的方法，其中每组中的每个探针包含不同的 标记。

17.如权利要求16所述的方法，其中每一组探针包含相同的标记。

18.如权利要求16所述的方法，其中第一组至少三个探针包括与第 二组至少三个探针中的至少两个探针相同的基因座退火的至少两个探针。

19.如权利要求16所述的方法，其中包含至少三个探针的至少三组 探针的每一组包括与其他组的探针中的探针相同的基因座退火的至少一 个探针。

20.如权利要求15、18或19所述的方法，其中与相同基因座退火的 每个探针包含相同的标记。

21.如权利要求1所述的方法，其中所述样品包含第二染色体的多核 苷酸片段，其中所述第二染色体不同于所述第一染色体。