[发明专利]用于预测先天性心脏缺陷的方法

权利要求书

1.一组基因在制备诊断试剂中的用途，所述诊断试剂用于预测易患室间隔缺损（VSD）的患者，其中所述一组基因是LASS3、ATPZA3、TTTY14、GPR123、ACAD10和TEX11基因的组合，所述诊断试剂被配制用于从所述患者的体液提取DNA并且测量所述患者的DNA中所述一组基因的胞嘧啶核苷酸的甲基化频率或百分比。

2.根据权利要求1所述的用途，其中所述诊断试剂还被配制用于：

A）从所述患者获得体液；

B）从所述体液提取DNA；

C）进行试验以确定整个基因组中基因座处的胞嘧啶的甲基化百分比；

D）将所述患者的胞嘧啶甲基化水平与正常组和室间隔缺损组的充分表征群体进行比较；和

E）基于整个基因组中不同位点处的胞嘧啶甲基化水平对所述患者患室间隔缺损的风险进行计算。

3.根据权利要求2所述的用途，其中所述体液选自由血液、血浆、血清、尿液、唾液或羊水组成的组。

4.根据权利要求2所述的用途，其中以许多不同组合的方式使用甲基化位点以计算所述患者中室间隔缺损的几率。

5.根据权利要求1至4中任一项所述的用途，其中所述患者为胎儿。

6.根据权利要求1至4中任一项所述的用途，其中所述患者为新生儿。

7.根据权利要求1至4中任一项所述的用途，其中所述患者为小儿患者。

8.根据权利要求1至4中任一项所述的用途，还包括确定出生后生活的任何时期的任何时间患室间隔缺损的风险或倾向。

9.根据权利要求2所述的用途，其中所述DNA是从所述体液中的细胞获得的。

10.根据权利要求2所述的用途，其中所述DNA是无细胞的。

11.根据权利要求2所述的用途，其中所述DNA是胎儿DNA或从产妇的体液获得的胚胎DNA。

12.根据权利要求5所述的用途，其中所述DNA是从出生时获得的羊水、胎儿血或脐带血获得的。

13.根据权利要求2所述的用途，其中获取并储存样品以进行病理学检查。

14.根据权利要求13所述的用途，其中将所述样品储存为玻片、组织块，或将所述样品冷冻。

15.根据权利要求1所述的用途，其中所述诊断试剂进一步被配制用于：

通过测量提取的DNA 中OR1OK1、EIF1AY、KHDC1、C7orf45、GALNS、PHKG2、ACOX3、NSMCE2、SRPK2、SLC25A21、PTPRN2和GFPT2中的两种或更多种的甲基化水平来确定所述易患室间隔缺损（VSD）的患者是否易患其他先天性心脏缺陷；和

鉴定易患其他先天性心脏缺陷的患者，其中

（i）OR1OK1和EIF1AY的甲基化差异指示易患法洛四联症（TOF），

（ii）KHDC1和C7orf45的甲基化差异指示易患主动脉瓣狭窄（AVS），

（iii）GALNS和PHKG2的甲基化差异指示易患左心发育不良综合征（HLHS），

（iv）ACOX3和NSMCE2的甲基化差异指示易患主动脉缩窄（Coarct），

（v）SRPK2和SLC25A21的甲基化差异指示易患房间隔缺损（ASD），和

（vi）PTPRN2和GFPT2的甲基化差异指示易患肺动脉瓣狭窄（PS）。

16.根据权利要求2所述的用途，其中所述试验为基于亚硫酸氢盐的甲基化试验。