[发明专利]耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)的鉴定

说明书

技术领域

本发明涉及耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)的鉴定，尤其是通过质谱进行鉴定。

背景技术

金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)(S.aureus)为芽孢杆菌目和葡萄球菌科细菌，常见于人类呼吸道和皮肤上。虽然金黄色葡萄球菌未必总是具有致病性，但它是皮肤感染(例如疖)、呼吸系统疾病(例如鼻窦炎)和食物中毒的普遍原因。目前已证实，它有获得抗菌剂耐药性的超常能力。20世纪80年代末，耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)开始在医院传播，随后开始出现社区获得性菌株(CA-MRSA)。目前它仍是医院获得性感染的五个最常见原因之一，并且通常是手术后伤口感染的原因。如今，耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)给全世界大多数国家的医院卫生带来了问题。

对甲氧西林的耐药性通过mec操纵子介导，该操纵子是葡萄球菌盒式染色体mec(SCCmec)的一部分。耐药性通过mecA基因获得，该基因编码改变的青霉素结合蛋白(例如PBP2a)，该蛋白结合β-内酰胺(青霉素、头孢菌素和碳青霉烯类)的亲和力较低。这使得在存在β-内酰胺的情况下，启动转肽酶活性，从而阻止它们抑制细胞壁合成。迄今为止，已检测出十一种不同的SCCmec类型以及多种亚型和变体。这些盒式染色体在序列和集成移动元件方面显示出高度多样性。

在临床实验室中，完整细胞的基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)正在越来越广泛地用于患者样本细菌的鉴定。通过MALDI-TOF MS鉴定细菌所使用的分析物离子(尤其是核糖体蛋白离子)通常具有单电荷，因此人们只需要简单参考离子的质量m。然而，更准确的术语是“电荷相关质量”m/z，实际上，这在质谱中是必需的。

已经有多项研究分析了通过质谱法(尤其是MALDI-TOF MS)区分甲氧西林敏感(易感)金黄色葡萄球菌(MSSA)与MRSA的可能性：

-Edwards-Jones V等，J.Med.Microbiol.,2000,49,295-300:“Rapid discrimination between methicillin-sensitive and methicillin-resistant Staphylococcus aureus by intact cell mass spectrometry”；

-Du Z.等，Anal.Chem.,2002,74,5487-5491:“Identification of Staphylococcus aureus and determination of its methicillin resistance by matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry”；

-Lu JJ.等，Anal.Chem.,2012,84,5685-5692:“Peptide biomarker discovery for identifica-tion of methicillin-resistant and vancomycin-intermediate Staphylococcus aureus strains by MALDI-TOF”；

-Bernardo K.等，Proteomics,2002,2,747-753:“Identification and discrimination of Staphylococcus aureus strains using matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight mass spectrometry”；

-Majcherczyk PA等，FEMS Microbiol.Lett,2006,255,233-239:“The discriminatory power of MALDI-TOF mass spectrometry to differentiate between isogenic teicoplanin-susceptible and teicoplanin-resistant strains of methicillin resis-tant Staphylococcus aureus”；